Stepp: تقنية SVM لتقييم الببتيدات النمط البوتنيات تطبيق لتقييم الببتيدات النمط البوتنيات
التحميل الان

Stepp: تقنية SVM لتقييم الببتيدات النمط البوتنيات الترتيب والملخص

Stepp: تقنية SVM لتقييم الببتيدات النمط البوتنيات العلامات

يقيم تقييم تصفح الببتيدات الببتيد تحديد الببتيدات المسمى ICPL تحديد كمالدي الببتيدات تحديد الببتيدات الببتيد البروتيني تقنية SVM تقييم الببتيد تقييم استخدام الكودون تقييم

Stepp: تقنية SVM لتقييم الببتيدات النمط البوتنيات وصف

Stepp هي أداة مساعدة متقدمة مصممة لحساب النتيجة التي تمثل كيفية "الببتيد" من قبل LC-MS. يمكن للبرنامج قراءة ملف البروتين، وأداء هضم في السيليكو، وحسب درجة إمكانية المراقبة لكل الببتيد المحترم أو جزئيا. لاحظ أن الدرجات الكبيرة (الإيجابية) تعني أن الببتيد من المتوقع أن يكون أكثر من البروتينات في حين أن الدرجات المنخفضة (السلبية) تعني الببتيد من المتوقع أن تكون البروتينية. يعد نموذج SVM المستخدمة من قبل STEPP مساحة واصف بسيطة بناء على 35 خصائص لمحتوى الأحماض الأمينية، وشحن، والمراعي، وقطبية القطبية للتنبؤ الكمي للببتيدات البروتينية. تم تدريب النموذج والتحقق من صحته مع قواعد بيانات AMT المستمدة بشكل مستقل (Shewanella Oneidensis، Salmonella Typhimurium، Yersinia Pestis). أسفرت SVM عن مقياس دقة متوسط قدره 0.8 من الانحراف المعياري بأقل من 0.025.

Stepp: تقنية SVM لتقييم الببتيدات النمط البوتنيات برامج ذات صلة