ideogrambrowser.

أداة Java لتصور الانحرافات الجينية باستخدام صفيف Affymetrix SNP
التحميل الان

ideogrambrowser. الترتيب والملخص

الإعلانات

  • Rating:
  • اسم الناشر:
  • Hans A. Kestler & Andr Mller
  • موقع ويب الناشر:
  • أنظمة التشغيل:
  • Windows All
  • حجم الملف:
  • 18.8 MB

ideogrambrowser. العلامات


ideogrambrowser. وصف

يمكن استخدام IDEOGRAMBROWSER على قارنها بسهولة مجموعة من ملفات الإخراج من أداة تحليل رقم نسخة ChromeSome Affymetrix. يتم تخفيض فقدان المغاير (LOH) أو علامات الخسارة / الكسب ضد منطقة الكروموسومات المقابلة في تمثيل Karyotygic جنبا إلى جنب مع الجينات. سمات: * تخطيط علامات SNP في Karyogram (دائما تم إنشاؤه جديدا من جدول قاعدة بيانات NCBI MAPVIVED 36.2). راجع الملحق أغير قاعدة البيانات الافتراضية. * يمكن استيراد أحجام مجموعة SNP من 10K، 50K، 100K، و 500K من أداة تحليل عدد النسخ Affymetrix (CNAT 3 و CNAT 4) مباشرة في تنسيق ملف CNT (الإصدار 1.0 و 1.1). * يمكن استيراد تنسيق ملف نصي محدد لعلامات تبويب عام لاستيراد البيانات الأجنبية (E.G. الناتج عن تطبيق جدول بيانات مثل Microsoft Excel). لذلك لا يقتصر البرنامج على صفائف Affymetrix SNP وأداة تحليل رقم نسخ Affymetrix (CNAT 3 و 4). يمكن دمج تحليل SNP على سبيل المثال مع صفيف بيانات CGH. تنسيق CNAT 4 الجديد ينقسم علامات اللحاء في ملف ثان. إذا كانت الملفات لها نفس البادئة يتم تحميل ملفات LOH تلقائيا عند فتح ملف رقم نسخ (CN). * تخطيط علامات الجينات من نسخة محلية من قاعدة بيانات NCBI MapView (Build 36.2) * معالجة الدفعات / استيراد الملفات المتعددة. دمج الملفات المنقسمة. * عتبة LOG2RATIOS، LOH (فقدان المغاير)، سبا (رقم نسخ تحليل النقاط الفردي)، و GSA (رقم نسخ ناعم الجينوم) لقيم توليد العلامة (هذا الأخير متاح فقط للبطاطا مع أكثر من 10K SNPs). * الحد من الضوضاء عبر وظيفة التصفية * تمثيل منطقة كونسسوس. * روابط إلى http://www.genecards.org * تصدير إلى JPG، SVG، وتنسيق PDF. * وظيفة الطباعة (قد لا تعمل الطباعة تحت نظام Linux بالاشتراك مع الكؤوس - هذه مشكلة Java 1.5 / Cups: تصدير الرسوم البيانية كملف PDF وطباعة E.G. مع قارئ Acrobat) * إلخ.


ideogrambrowser. برامج ذات صلة

معلومات عنا