SEQ-GEN.

يحاكي تطور تسلسل الحمض النوكليوتيد أو الأحماض الأمينية
التحميل الان

SEQ-GEN. الترتيب والملخص

الإعلانات

  • Rating:
  • رخصة:
  • Freeware
  • اسم الناشر:
  • Andrew Rambaut
  • أنظمة التشغيل:
  • Windows All
  • حجم الملف:
  • 281 KB

SEQ-GEN. العلامات


SEQ-GEN. وصف

تم تطوير SEQ-GEN ليكون برنامجا سيؤدي إلى محاكاة تطور تسلسل الحمض النوكليوتيد أو الأحماض الأمينية على طول Phylogeny، باستخدام نماذج مشتركة لعملية الاستبدال. يتم تنفيذ مجموعة من النماذج من التطور الجزيئي بما في ذلك النموذج العام قابل للانعكاس. يمكن إعطاء ترددات الدولة ومعلمات أخرى للنموذج ويمكن أيضا دمج عدم تجانس أسعار المواقع الخاصة بالموقع في عدد من الطرق. يمكن قراءة أي عدد من الأشجار وسيؤدي البرنامج إلى إنتاج أي عدد من مجموعات البيانات لكل شجرة. وبالتالي، يمكن إنشاء مجموعات كبيرة من عمليات المحاكاة المتكررة بسهولة. تم تصميمه ليكون محاكي للأغراض العامة التي تتضمن معظم النماذج المستخدمة بشكل شائع (وقطاعيا) تطور التسلسل الجزيئي. SEQ-GEN عبارة عن برنامج يتحكم في سطر الأوامر مكتوبا في ANSI C. يجب تجميعها بسهولة وتشغيلها على أي نظام UNIX أو محطة عمل. تصف هذه الورقة استخدام SEQ-GEN على جهاز Unix. يتطلب التطبيق كمية من الذاكرة يتناسب مع حجم كل مجموعة بيانات التسلسل المحاكاة. تشغيل SEQ-GEN لتشغيل SEQ-GEN SEQ-GEN <> حيث هي المعلمات للبرنامج (الموضح أدناه)، هي ملف الأشجار و هو اسم الملف الذي سيحتوي على تسلسل محاكاة. يجب أن يحتوي ملف الشجرة على شجرة واحدة أو أكثر في تنسيق phylip. تتم كتابة التسلسلات التي تنتجها SEQ-Gen إلى الإخراج القياسي (ويمكن إعادة توجيهها إلى ملف الإخراج باستخدام> ). تتم كتابة المعلومات والنتائج الأخرى إلى الخطأ القياسي، وبالتالي ستظهر على الشاشة.


SEQ-GEN. برامج ذات صلة

rate4site.

برنامج للكشف عن مواقع الحمض الأمينية المحفوظة ...

195 372 KB

تحميل

سيسي

محاكاة تطور التسلسل مع تفاعلات خاصة بالموقع ...

203 104 KB

تحميل