SEQ-GEN.يحاكي تطور تسلسل الحمض النوكليوتيد أو الأحماض الأمينية | |
التحميل الان |
SEQ-GEN. الترتيب والملخص
الإعلانات
SEQ-GEN. العلامات
- محاكاة تسلسل حامض الحمضة المعايرة نسبة النيوكليوتيد الخط الحمضي رمز المفتاح صفقة الأحماض تحليل الحمض النووي تسلسل النوكليوتيد مدير تسلسل النوكليوتيد النيوكليوتيد محاكاة التطور العثور على الأحماض الأمينية مكتشف الأحماض الأمينية بحث عن الأحماض الأمينية محلل الأحماض الأمينية تسلسل الحمض الأميني حمض أميني مترجم حمض الأميني موضوع الحمض استخراج الأحماض الأمينية حل الحمض بقايا الأحماض الأمينية الحمض الأميني الأمثل استبدال النيوكليوتيد نموذج عزر النوكليوتيد تسلسل الحمض النووي استبدال النيوكليوتيد شرح النوكليوتيد محاذاة النوكليوتيد تحليل الأحماض الأمينية حمض نووي تحليل زوج الأحماض الأمينية الأحماض الأمينية تحليل زوج تحليل تسلسل الأحماض الأمينية تحليل تسلسل الأحماض الأمينية تصنيف الأحماض الأمينية طوبولوجيا الأحماض الأمينية محاكي التقييم كاشف أميني حمض كشف الحمض الأميني تعدد الأشكال النوكليوتيد طفرة النيوكليوتيد جزء النوكليوتيدات تحليل سلسلة الأحماض الأمينية حوافة الحمض معاملات الحمضية هوتميل تكسير كلمة السر حمض الموالية حمض الموالية 7. تطبيق ألعاب آلة ألبانيا الإنجليزية فقاعات على الانترنت طابعة نفث الحبر C3125. رسالة نصية عبر الهاتف المحمول الهدف الموالية ل المياه المتتابعة غلوك 26 جنرال تحويل ISO EM بطاقة الائتمان Gen. امتحانات ممارسة الشمس UMD Gen.
SEQ-GEN. وصف
تم تطوير SEQ-GEN ليكون برنامجا سيؤدي إلى محاكاة تطور تسلسل الحمض النوكليوتيد أو الأحماض الأمينية على طول Phylogeny، باستخدام نماذج مشتركة لعملية الاستبدال. يتم تنفيذ مجموعة من النماذج من التطور الجزيئي بما في ذلك النموذج العام قابل للانعكاس. يمكن إعطاء ترددات الدولة ومعلمات أخرى للنموذج ويمكن أيضا دمج عدم تجانس أسعار المواقع الخاصة بالموقع في عدد من الطرق. يمكن قراءة أي عدد من الأشجار وسيؤدي البرنامج إلى إنتاج أي عدد من مجموعات البيانات لكل شجرة. وبالتالي، يمكن إنشاء مجموعات كبيرة من عمليات المحاكاة المتكررة بسهولة. تم تصميمه ليكون محاكي للأغراض العامة التي تتضمن معظم النماذج المستخدمة بشكل شائع (وقطاعيا) تطور التسلسل الجزيئي. SEQ-GEN عبارة عن برنامج يتحكم في سطر الأوامر مكتوبا في ANSI C. يجب تجميعها بسهولة وتشغيلها على أي نظام UNIX أو محطة عمل. تصف هذه الورقة استخدام SEQ-GEN على جهاز Unix. يتطلب التطبيق كمية من الذاكرة يتناسب مع حجم كل مجموعة بيانات التسلسل المحاكاة. تشغيل SEQ-GEN لتشغيل SEQ-GEN SEQ-GEN <> حيث هي المعلمات للبرنامج (الموضح أدناه)، هي ملف الأشجار و هو اسم الملف الذي سيحتوي على تسلسل محاكاة. يجب أن يحتوي ملف الشجرة على شجرة واحدة أو أكثر في تنسيق phylip. تتم كتابة التسلسلات التي تنتجها SEQ-Gen إلى الإخراج القياسي (ويمكن إعادة توجيهها إلى ملف الإخراج باستخدام> ). تتم كتابة المعلومات والنتائج الأخرى إلى الخطأ القياسي، وبالتالي ستظهر على الشاشة.
SEQ-GEN. برامج ذات صلة