معتزم

إنشاء مجموعات من القراءة الاصطناعية مع هذا التطبيق.
التحميل الان

معتزم الترتيب والملخص

الإعلانات

  • Rating:
  • رخصة:
  • Freeware
  • اسم الناشر:
  • Daniel H. Huson
  • حجم الملف:
  • 14.7 MB

معتزم العلامات


معتزم وصف

Metasim هي أداة مفيدة مصممة خصيصا لمساعدتك في إنشاء مجموعات من القراءات الاصطناعية التي تعكس التركيب التصنيفي المتنوع لمجموعات بيانات Metagenome النموذجية. بناء على قاعدة بيانات للجينومات المعطاة، يسمح البرنامج للمستخدم بتصميم مخطط من خلال تحديد عدد الجينوم الموجود على مستويات مختلفة من تصنيف NCBI، ثم لجمع يقرأ من Metagenome باستخدام محاكاة لعدد من تقنيات التسلسل المختلفة وبعد تنتج عينات السكان اختياريا تسلسل متطورا على أساس الجينوم المصدر وشجرة تطورية معينة. يمكن استخدام مجموعات البيانات الناتجة كسيناريوهات اختبار موحدة للتخطيط لمشاريع التسلسل أو لبرامج التجميع والمعايير. الخصائص الرئيسية: يدمج قاعدة بيانات لتسلسلات الجينوم المصدر يولد مجموعات من القراءات الاصطناعية أو أزواج رفيقه بناء على نماذج خطأ تسلسل قابلة للتكيف (E.G. لكيمياء Sanger، Roche 454 و Illumina (Solexa السابق) تمكن المستخدم من تكوين قيم الوفرة لكل كائن حي لنموذج تكوينات Accounts المحددة يوفر عينات سكانية لتوليد تسلسل متطورا على أساس الجينومات المصدر وشجرة تطورية معينة يمكن السيطرة عليها عبر واجهة المستخدم الرسومية أو في وضع سطر الأوامر


معتزم برامج ذات صلة

rnapasta.

تحليل تسلسل الحمض النووي الريبي مع هذه الأداة. ...

160 5.7 MB

تحميل

فريدا

تحليل مجموعات بيانات الصور الخاصة بك مع هذه الأداة ...

193 1.9 MB

تحميل

metannogen.

إرفاق اليدوي الشراحية على ردود الفعل من قبل فريق من القيمين. ...

85 1 KB

تحميل