محمل قاعدة بيانات WPDB

التحميل الان

محمل قاعدة بيانات WPDB الترتيب والملخص

الإعلانات

  • Rating:
  • رخصة:
  • Freeware
  • اسم الناشر:
  • Ilya Shindyalov & Phil Bourne
  • أنظمة التشغيل:
  • Windows All
  • حجم الملف:
  • 255 KB

محمل قاعدة بيانات WPDB العلامات


محمل قاعدة بيانات WPDB وصف

محمل قاعدة بيانات WPDB هو أداة مفيدة وسهلة الاستخدام مصممة خصيصا لمساعدتك في استجواب الهيكل الأبعاد ثلاثي الأبعاد للمكائنات الكبيرة البيولوجية كما هو موجود في بنك بيانات البروتين (PDB) باستخدام استعلام وأدوات عرض مثل تلك المذكورة أعلاه. الخصائص الرئيسية: العلمي: ابحث عن هياكل بناء على عمليات البحث النصية والتسلسلات (عدم التطابق المسموح بها). تسلسل محاذاة تسلسل تسجيل واحد مقابل تسلسلات مستهدفة متعددة وفقا لطريقة الإبرة والهيوش (JMB 48 (3): 443-453، 1970). تراكم الهيكل باستخدام مواقع كالفا وفقا لطريقة هندريكسون (Acta Crysta35: 158-163، 1979. مهام هيكل ثانوي وفقا لطريقة kabsch و sander. تحليل ملف تعريف الملكية الأمينية الحمضية، سواء ثابت وديناميكي: ثابت وفقا للقيم التي جمعها Bogardt et al؛ ديناميكي، يعني التعرض وفقا ل Lee و Rechards (JMB 55: 379-400 و 1971) والمعاملات التجريبية BPROFILELPLEFLEFLEFLEFLEFLEFLEFILE تحليل خريطة الاتصال في مسافات قطع مختلفة ومع مجموعات ذرة مختلفة في هياكل اتصالات أو الهياكل المثيرة (خرائط الاتصال الفرق) يمكن فحصها. عرض نموذجي ثلاثي الأبعاد وتقديمه، بما في ذلك الخيارات لعرض أو تسليط الضوء على البنية التحتية، وتمثيل CPK، والأسطح البسيطة (الملونة بناء على المسافة من المستخدم). حساب الهندسة (أطوال السندات، زوايا السندات، زوايا Dihedral، اتصالات إغلاق غير مرتبطة) بما في ذلك التمثيل الرسومي والانحرافات من مسافات الجزيء الصغيرة. الحوسبة: ضغط البيانات - حوالي 20 أضعاف تخزين في تخزين ملف PDB ASCII، ولكن مع: (1) المعلومات الببليوغرافية تقتصر على سجلات المؤلف و JRNL؛ (2) اختياريا أول أو جميع أعضاء فرقة من هياكل NMR أو النموذجين المدرجة؛ (3) فقط أول مطابقة بديل على النحو المحدد في ملف PDB لأجزاء من بنية بلورية مع شاغلي جزئي؛ (4) الإحداثيات الذرية تقريب إلى 2 وليس 3 منازل عشرية؛ (5) عدم وجود سجلات ملاحظة PDB. كائنات عرض قابل للتشغيل البيني - عند تحديد ميزة في كائن عرض واحد (خريطة اتصال E.GA)، يتم أيضا تحديث جميع كائنات العرض المرئية الأخرى (E.G3-D المشاهد) وأولئك الذين تم استدعاءهم لاحقا، لتوضيح هذه الميزة . الوصول المباشر إلى RASWIN برنامج العرض الجزيئي الشهير. وثائق مطبوعة متزامنة ومساعدة حساسة للسياق تم إنشاؤها باستخدام حزمة Doctohelp.


محمل قاعدة بيانات WPDB برامج ذات صلة

جمل

آلة حاسبة علمية لحسابات الوزن الجزيئي والحجم. ...

211 60 KB

تحميل

ideogrambrowser.

أداة Java لتصور الانحرافات الجينية باستخدام صفيف Affymetrix SNP ...

184 18.8 MB

تحميل