فرض

مجموعة أدوات التخلص من بقايا البروتين
التحميل الان

فرض الترتيب والملخص

الإعلانات

  • Rating:
  • رخصة:
  • Freeware
  • اسم الناشر:
  • Huzefa Rangwala
  • أنظمة التشغيل:
  • Windows All
  • حجم الملف:
  • 363 KB

فرض العلامات


فرض وصف

تم تطوير مجموعة أدوات Prosat لتكون مجموعة من البرامج تسمح ببناء النماذج القائمة على SVM للتعليق على بقايا الأحماض الأمينية في تسلسل البروتين باستخدام الميزات الموردة للمستخدم (مثل ملفات تعريف PSI-Blast، أو ملفات تعريف PSIPRED). على وجه الخصوص، تقوم مجموعة الأدوات ببناء ميزات باستخدام نافذة حول البقايا، وهي مجهزة بوظيفة Kernel متخصصة (وظيفة NSOOE NSOE DESTOLE NSOE) جنبا إلى جنب مع وظيفة Kernel NSOE SPM النموذجية العادية. prosat_learn هو البرنامج لمعرفة نماذج تصنيف "N" واحدة مقابل الراحة، حيث يكون N عدد التعليقات التوضيحية المحتملة. يمكن أن يتعلم أيضا نموذج الانحدار ناقلات الدعم للتنبؤ بقيمة نقطة عائمة. الاستخدام Prosat_learn prosat_predict هو البرنامج للتنبؤ بالشروحية لكل بقايا من النماذج المدمجة، وإخراج ملف تعريف أبعاد L XN، إخراج النتيجة من كل واحد مقابل N راحة نماذج SVM لكل بقايا الأحماض الأمينية و L طول تسلسل البروتين. في حالة وجود نموذج الانحدار، ن = 1. الاستخدام prosat_predict. الإدخال Prosat_predict لديه ثلاثة معلمات مطلوبة: - ملف الاختبار: يوفر ملف الاختبار قائمة ميزات التسلسل التي نحتاجها للتنبؤ بملفات تعريف التوضيحية. يشبه ملف الإدخال المستخدم في prosat_learn إلا أنه لا يحتوي على أسماء ملفات التوضيحية الحقيقية، لأننا نتنبأ نفس الشيء. - ملف نموذج: الملف النموذجي هو ملف النموذج المخرج من Prosat_learn - ملف التنبؤ: يوفر ملف التنبؤ المسار وبادئة تنبؤات الإخراج في شكل ملفات تعريف التوضيحية. الناتج يتكون الناتج من مجموعة من التعليقات التوضيحية والملفات الشخصية المتوقعة، والتي ليست سوى تنبؤات SVM من كل من نماذج SVM "Numem Element".


فرض برامج ذات صلة

GDA.

الارتباط والجهاز الهاردي-وينبرغ عدم توحيده صنع سهل. ...

241 732 KB

تحميل