dawgpaws. تساعد مجموعة عمل توضيحية موزع (DAWG) في شرح التسلسل لطريق بحجم BAC
التحميل الان

dawgpaws. الترتيب والملخص

dawgpaws. العلامات

تسلسل علق جين التوضيحي الجينات annotate الجينات الشرح التسلسل

dawgpaws. وصف

يساعد الفريق العامل التوضيحي الموزع (DAWG) في التعليق التوضيحي في توضيح البكالوريا Dawgpaws هو مجموعة من برامج سطر الأوامر المكتوبة في بيرل التي تسرع في التعليق التوضيحي للجينات وعناصر التعريف في الجينومات النباتية من خلال أتمتة عملية تشغيل برامج التوضيحية وتسهيل العلامة التوضيحية المشتركة. Bacs، تتم الإشارة إليها كخطوط أنابيب لإلحاقات القمح (الكفوف). على الرغم من أن هذه البرامج مصممة في البداية من أجل القمح، إلا أن البرامج النصية يمكن تطبيقها بسهولة أيضا على أي خطوط خط أنابيب Eunoation Eunoation Eunoation. عدد برامج الشرع التسلسل الموجودة. يتم تحويل هذه النتائج من الإخراج الأصلي لبرامج التوضيح الفردية إلى تنسيق ملف GFF القياسي. نظرا لأن ملف GFF هو علامة تبويب بسيطة مخطط نصية مخطط، يمكن بسهولة التقطت النتائج الحاسوبية للتسلسل الفردي معا باستخدام أدوات Maninpulation للنص القياسية مثل Cat؛ والدليل على أن القطط والدويج يمكن أن تلعب جيدا معا. يوفر Dawgpaws أدوات إضافية لتسهيل استخدام أداة العلامة التوضيحية Cheoome Apollo للتصور وعلامة النتائج الحسابية. فيما يلي بعض الملامح الرئيسية "Dawgpaws": التلاعب في ملف FASTA لإعداد تسلسل لخط أنابيب التوضيح شرح الثغرات في تجميعات التسلسل تنفيذ AB Initio Gene Outation وبرامج التوضيحية عناصر التعويذة في خط أنابيب إنتاجية عالية خط أنابيب الانفجار مناسب للاستخدام في إطار الحوسبة العنقودية تحويل الإخراج من برامج التوضيحية إلى تنسيق ملف GFF المشترك تحويل ملفات GFF إلى تنسيق Game.xml المساعدة متوفرة في جميع برامج سطر الأوامر باستخدام إشارات سطر الأوامر. معلومات المساعدة والملفات اليدوية الكاملة لا تزال قيد التطوير لبعض البرامج تتوفر الصفحات اليدوية للبرامج الفردية على موقع Dawgpaws على الويب وتضمين في DREALE-1.0 Download of the Dawgpaws Suite.

dawgpaws. برامج ذات صلة