 | mspire.أدوات مصدر مجانية ومفتوحة للبروتوكولات الطيفية للكتلة في Ruby |
| التحميل الان | |
mspire. الترتيب والملخص
الإعلانات
- رخصة:
- Freeware
- السعر:
- FREE
- اسم الناشر:
- mspire Team
- موقع ويب الناشر:
- http://mspire.rubyforge.org/
- أنظمة التشغيل:
- Mac OS X
- حجم الملف:
- 2.9 MB
mspire. العلامات
mspire. وصف
أدوات المصدر المجانية والمفتوحة لبروتوميكيات الطيف الجماعي في روبي Mspire (Proteomics الكتلي الطيفي في Ruby) عبارة عن مجموعة من الأدوات للعمل مع بيانات MS ProTeutomics في Ruby. يسعى MSPire إلى تقديم الدعم للمعايير المفتوحة (على سبيل المثال، MZXML، المحللون ل MzDATA، Peptide / Protein النبي و TPP) والمساهمة في الوظائف المفيدة الأخرى للعمل مع بيانات الطيف الجماهيرية في Ruby.The المشروع يركز حاليا على ما يلي: التسلسل البيانات (خاصة إخراج Bioworks 3.2-3.3) Mzxml mzdata البروتينبروف إعداد الملفات ل Obiwarpvalidation حسب: خيارات بحث قاعدة بيانات Decoy المختلفة: عكس / خلط ورق اللعب، متسلسل / منفصل، مع خيارات التجزئة المختلفة (على سبيل المثال، بواسطة حمض أميني تسلسل + تهمة) الأحماض الأمينية (على سبيل المثال، البحث عن السيلات غير المحظورة) تنبؤ الحمل (الرهاب أو الطبقة) تحيز عينة عامة (مثل، وفرة منخفضة / بروتينات وفرة عالية) عينة محددة هنا هي بعض الميزات الرئيسية ل "mspire": mzxml (الإصدار 1، 2، و 3) تحليل تحليل mzdata BioWorks .srf (الملفات الثنائية) القارئ قراءة / كتابة ملفات .sqt BioWorks إلى PeptideProphet الإدخال (ملفات PEPXML) قيم قيم خفيفة الوزن المحلل رسامي الاحتمالات البروتين ملاحظات ملخص البروتين مع قيم قطع معرف كاذبة مخصصة تحويل إلى ملفات إدخال OBI-WARP المحمولة: يعمل عبر منصات ما الجديد في هذا الإصدار: استخدام PI_ZERO بدلا من Decoy_to_target_ratio. في حين أن جميع الاختبارات تمر، يجب النظر في هذا الإصدار تجريبي لاستخدام أي التحقق من صحة المستهدف.
mspire. برامج ذات صلة
