Lammss.

المحمولة الذرية / الجزيئية على نطاق واسع محاكي متوازي
التحميل الان

Lammss. الترتيب والملخص

الإعلانات

  • Rating:
  • رخصة:
  • GPL
  • السعر:
  • FREE
  • اسم الناشر:
  • Steve Plimpton
  • موقع ويب الناشر:
  • http://lammps.sandia.gov/
  • أنظمة التشغيل:
  • Mac OS X or later
  • حجم الملف:
  • 14.7 MB

Lammss. العلامات


Lammss. وصف

المحمولة على نطاق واسع الذرية / الجزيئية واسع محاكي الموازي LAMMPS هو رمز الديناميات الجزيئية الكلاسيكية (MD). كما يوحي الاسم، أنها مصممة لتعمل بشكل جيد على أجهزة موازية، ولكنه يمتد أيضا غرامة على machines.LAMMPS سطح المكتب معالج واحد هو محمول للغاية. يجب أن نبني على أي منصة مع مترجم C ++. وGNU ز ++ المترجم أو المجمعين التجارية تعمل بشكل جيد. وقد تم بناء LAMMPS لعدة متوازية وسطح المكتب الآلات، التي تعمل ماك OS X، يونكس أو لينكس variants.LAMMPS لديها إمكانات للمواد الناعمة (الجزيئات الحيوية، والبوليمرات) والمواد الصلبة (المعادن وأشباه الموصلات)، ونظم الخشنة الحبوب. ويمكن استخدامه لذرات نموذج أو أكثر بشكل عام، وجهاز محاكاة الجسيمات موازية في تشغيل متوسطة المدى أو متصلة levels.LAMMPS على أجهزة معالج واحد أو بالتوازي باستخدام تقنيات تمرير رسالة والتحلل المكاني للمجال المحاكاة. تم تصميم رمز لتكون سهلة لتعديل أو تمديد مع وظائف جديدة. وهنا بعض الملامح الرئيسية "LAMMPS": يعمل على معالج واحد أو بالتوازي توزيع الذاكرة تمرير رسالة التوازي (MPI) المكاني التحلل المجال محاكاة لالتوازي توزيع المفتوحة المصدر عالية محمولة C ++ المكتبات الاختيارية المطلوبة: MPI ومعالج واحد الاتحاد الفرنسي للتنس في موازاة ذلك، تشغيل واحد أو عدة عمليات المحاكاة في وقت واحد من السهل على تمديد مع الميزات الجديدة والوظائف الذرات، والبوليمرات، والجزيئات، والمعادن، والجسيمات الحبيبية، الجسيمات الخشنة الحبيبات، القطع الناقص، نقطة ثنائيات الاقطاب، أو مجموعات مختلطة من هذه إمكانات زوجيا: لينارد جونز، باكنغهام، مورس، يوكاوا، لينة، والطبقة 2 (البوصلة)، جدولة إمكانات زوجيا مشحونة: Coulombic، نقطة ثنائي القطب إمكانات manybody: EAM، Finnis / سنكلير زير الشئون الخارجية، وزير الشؤون الخارجية معدلة (MEAM)، Stillinger ويبر، Tersoff، AI-REBO إمكانات الخشنة الحبوب: الحبيبية، DPD، GayBerne، الغروية إمكانات السندات: متناسق، FENE، مورس، غير الخطية، والطبقة 2، الدرجة الرابعة (قابلة للكسر) إمكانات زاوية: التوافقية، CHARMM وجيب التمام وجيب التمام / مربع، والطبقة 2 (البوصلة) إمكانات ثنائي السطح: التوافقية، CHARMM ومتعددة التوافقي، الحلزون، والطبقة 2 (البوصلة)، OPLS إمكانات غير لائقة: التوافقية، cvff، الفئة 2 (البوصلة) إمكانات الهجين: متعددة الزوج، والسندات، وزاوية، ثنائي السطح وإمكانيات غير سليمة يمكن استخدامها في محاكاة واحدة إمكانات تراكب إعلان: تراكب الجهد الثنائي متعددة إمكانات البوليمر: كل ذرة، متحدين ذرة، حبة الربيع، قابلة للكسر إمكانات المياه: TIP3P، TIP4P، SPC إمكانات مذيب الضمنية: تزييت الهيدروديناميكية، ديباي طويلة المدى Coulombics والتشتت: ايوالد، PPPM (على غرار الجسيمات شبكة ايوالد)، ايوالد / N لفترة طويلة المدى لينارد جونز CHARMM، AMBER، والتوافق OPLS قوة الحقل 2D أو 3D أنظمة متعامد أو غير المتعامدة (التماثل triclinic) مجالات محاكاة ثابت NVE، NVT، NPT، في تكامل NPH خيارات thermostatting للمجموعات ومناطق هندسية من ذرات السيطرة على ضغط عن طريق الأنف / هوفر barostatting في 1-3 أبعاد مربع محاكاة تشوه (الشد والقص) التوافقية (مظلة) القوات القيد مستقل أو إلى جانب التكامل هيئة جامدة السندات SHAKE وزاوية القيود جدران أنواع مختلفة المستهدفة ديناميات الجزيئية (TMD) القيود عدم التوازن ديناميات الجزيئية (NEMD) مجموعة من الشروط والقيود الحدودية إضافية سرعة-Verlet تكامل ديناميات البراونية التقليل من الطاقة عن طريق الاسترخاء المترافقة التدرج rRESPA الهرمية timestepping بالتوازي هدأ (تبادل طبق الأصل) تشغيل المحاكاة مستقلة متعددة في وقت واحد ملف سجل من المعلومات thermodynanmic ملفات تفريغ النص من احداثيات ذرة، السرعات، وغيرها من كميات لكل ذرة ملفات ثنائي إعادة تشغيل كميات لكل ذرة (الطاقة، والإجهاد، المعلمة تصلب مركز التماثل، الخ) حسابات (ملف السجل) على نطاق منظومة المعرفة من قبل المستخدم أو لكل ذرة (ملف تفريغ) المتوسط المكاني ووقت كميات لكل ذرة المتوسط الوقت الكميات على نطاق المنظومة لقطات ذرة في، XYZ، صيغ XTC، DCD الأم ما الجديد في هذا الإصدار: الإصدار الجديد من LAMMPS (C ++ الإصدار). 138720 خطوط من التعليمات البرمجية في دير SRC مع جميع حزم وشملت (ولكن لا الملفات المصدر مكتبة). هام: بناء جملة الأوامر التالية قد تغيرت: pair_style غران / هوك، pair_style غران / هوك / التاريخ، pair_style غران / هرتز / التاريخ، وspecial_bonds. تم تغيير الكلمة "سمة" في الأمر تفريغ مخصص ل"المعرف". تم تغيير الافتراضي لتحديد سمك طبقة في الإصلاح افي الأمر / المكاني من وحدات مربع إلى وحدات شعرية.


Lammss. برامج ذات صلة

زخر

أدوات لمعالجة البيانات والصور العلمية وتصورها ...

140 1.5 MB

تحميل

easysvm

مصدر الأمام الأمامي مفتوح المصدر في المصدر إلى Toolbox Shogun ...

160 468 KB

تحميل

DCAS الأثير

تطبيق المصدر المجاني والمفتوح يوفر تبسيط الجبر المخصص وإعادة ترتيب ...

152 55 KB

تحميل