نظم أعمال البيولوجيا مصدر مجاني ومفتوح وإطار بسيط للتطبيق بين الاتصالات
التحميل الان

نظم أعمال البيولوجيا الترتيب والملخص

نظم أعمال البيولوجيا العلامات

تطبيق إطار الاتصالات تواصل يتواصل طلب طلب التطبيق بين الاتصالات

نظم أعمال البيولوجيا وصف

مجانا، مفتوح المصدر والإطار بسيط للتطبيق بين الاتصالات نظم Workbench Systems Biology (SBW)، هو إطار برنامج يسمح بمكونات تطبيقات غير متجانسة - الكتابة في لغات البرمجة المتنوعة وتشغيلها على منصات مختلفة - للتواصل واستخدام إمكانيات بعضها البعض عبر نظام رسائل ثنائية سريعة. نظم Biology Workbench هدف Workbench هو إنشاء بنية تحتية بسيطة وعالية الأداء والفتح مفتوحة المصدر والتي من السهل تنفيذها وفهمها. تتيح SBW التطبيقات (يحتمل أن تعمل على أجهزة كمبيوتر منفصلة أو موزعة) للتواصل عبر بروتوكول شبكة بسيط. يتم تغليف الواجهات إلى النظام في مكتبات العميل التي نقدمها لغات البرمجة المختلفة. يتكون SBW من مكونين، وسيطا لرسائل التوجيه والوحدات النمطية التي ترسل وتلقي الرسائل. جميع الاتصالات بين الوحدات النمطية والوساطة هي من خلال مآخذ TCP / IP القياسية. يتم إرسال جميع الرسائل بتنسيق ثنائي للأداء الأقصى للأداء. إذا تم إرسال رسالة من أجهزة كمبيوتر مختلفة، فسيتم إرسال الرسائل أولا إلى الوسيط على الجهاز البعيد، وهذا بدوره يسجل الرسالة إلى الوحدة النمطية البعيدة الصحيحة. قد تكون مكتوبة بمجموعة متنوعة من اللغات، بما في ذلك، C / C، Java، Perl، Python، Delphi، و Matlab.Note: SBW صدر تحت رخصة BSD. ما الجديد في هذا الإصدار: تحليل الحفظ: إعادة كتابة أداة تحليل الحفظ، العائد أداء أفضل وموثوقية وحدة Clapack: إعادة كتابة وحدة Clapack لتحسين الأداء والموثوقية ج # المفتش: السماح بإدخال صفائف معقدة تحدد أرقام معقدة باستخدام التنسيق: '(' '+' ') تحسينات مع توجيه الاستثناء وتحسين واجهة المستخدم Hystanalysis Ui: إصلاحات طفيفة للتعامل مع SBML غير صالح الجرارناق: المنطقة الثابتة التعامل مع الأرقام اسمح بتحميل SBML مباشرة إلى محرر مع ترجمة تلقائية إلى Jarnac. وأضاف شريحة (مصفوفة، Lownindex، TeralNdex) وظيفة لجعلها من السهل إلى تمديد الصفوف من مصفوفة. تمت إضافة Timeslice (M، Lowertime، TighttimeTime) وظيفة، تمت إضافته لدعم وظائف محاكاة الاستوكاستك الجديدة وتمكين المستخدم من استخراج البيانات من محاكاة عشوائية بين النقاط الزمنية. يجب إنشاء البيانات من أي من مكالمات محاكاة Gillxxx. تفترض الوظيفة أن العمود الأول من البيانات هو متغير الوقت. وأضاف عدد من الوظائف الجديدة لاستدعاء وحدة GillDM في SBW. هذا يسمح الوصول إلى SToCastic Access to A يجب أن يتم اختباره بشكل أسرع ومختبر بالكامل، وأساليب جديدة تشمل: GillLoadsBML (SBMLSTR): EG GillLoadsBML (P.XML) Gillsimulate (بدء تشغيل الوقت، والهندسة، وتصفية): قم بتعيين فترة الاستيلاء على واحدة للحصول على جميع البيانات GillsimulyGrid (StartTime، ENDTIME. GLEDSIZE) GillsimulateMeanongrid (بدء الوقت، والاطلاسبات، والبابات السكانية): يحاكي عدد سكان يعمل على الشبكة وإرجاع المسار المتوسط. gillsimulatemeanandsdongrid (بدء الوقت، واطلال نهاية، سميها، إجماليا): نفس الشيء السابق باستثناء أنها ترجع أيضا الانحراف المعياري بمرور الوقت لكل نوع. SETSED (SEED): اضبط بذور الرقم العشوائي، يسمح بالتشغيل المراد تكراره بالضبط. (يجب أن تكون البذور قيمة عدد صحيح). خطأ ثابت في الوصول إلى قائمة SBW. إضافة وظيفة PDF (م). سيحصل ذلك على وظيفة كثافة الاحتمالات لتوجيه البيانات المرفقة في الوظيفة. وأضاف Graphhist (M) هذا هو نفسه الرسم البياني ولكن بدلا من ذلك يتأخر الرسم البياني بدلا من الرسم البياني الخطي.

نظم أعمال البيولوجيا برامج ذات صلة