 | lfpy.وحدة نمطية لنمذجة إمكانات الميدان المحلي المدمج على الخلايا العصبية |
| التحميل الان | |
lfpy. الترتيب والملخص
الإعلانات
lfpy. العلامات
lfpy. وصف
LFPy هو وحدة بيثون لحساب إمكانات خارج الخلية من الخلايا العصبية multicompartment models.It تعتمد على محاكاة NEURON (http://www.neuron.yale.edu/neuron) ويستخدم واجهة بيثون (HTTP: //www.frontiersin. غزاله / معلوماتية عصبية / 10.338 /neuro.11.001.2009/abstract) أنه provides.LFPy يوفر مجموعة من الطبقات بيثون سهلة الاستخدام لإنشاء النموذج الخاص بك، وتشغيل المحاكاة وحساب إمكانات خارج الخلية الناجمة عن النشاط في الخلايا العصبية النموذج الخاص بك . إذا كان لديك نموذج العمل في NEURON بالفعل، فمن المرجح أنه يمكن تكييفها للعمل مع LFPy.The إمكانات خارج الخلية وتحسب من التيارات عبر الغشاء في نماذج الخلايا العصبية متعددة المقصورة باستخدام طريقة القسط المصدر (هولت وكوخ، J شركات Neurosci 1999)، ولكن أبسط طريقة نقطة المصدر هو متاح أيضا. تفترض الحسابات أن الخلايا العصبية محاطة سيلة خارج الخلية لانهائية مع الموصلية مستقلة متجانسة والتردد، ويفترض المقصورات أن تكون على الأقل على مسافة الحد الأدنى من القطب (والتي يمكن أن تكون محددة من قبل المستخدم). لمزيد من المعلومات حول الفيزياء الحيوية التي يقوم عليها الإطار العددي تستخدم رؤية هذا الفصل كتاب القادمة: - K.H. بيترسن، H. ليندن، صباحا دايل وG.T. Einevoll: المسامير خارج الخلية والكثافة مصدر في الوقت الراهن، في * كتيب العصبية آخر قياس *، التعديل الأخير تم بواسطة R. Brette وA. Destexhe، كامبريدج، لتظهر لورقة PDF.In النسخة الحالية تم تصميم LFPy أساسا لمحاكاة الخلايا العصبية واحدة. وقد وضعت LFPy في المجموعة الحاسوبية علم الأعصاب (http://compneuro.umb.no)، قسم العلوم Mathemathical والتكنولوجيا، في الجامعة النرويجية لعلوم الحياة (http://www.umb.no)، بالتعاون مع مختبر معلوماتية عصبية (http://www.nencki.gov.pl/en/laboratory-of-neuroinformatics)، معهد نينكي البيولوجيا التجريبية (http://www.nencki.gov.pl)، وارسو، بولندا. وأيد الجهود المبذولة من قبل مرفق الدولي معلوماتية عصبية التنسيق (http://incf.org) ومجلس البحوث في النرويج (http://www.forskningsradet.no/english) (مجال العلوم الالكترونية، NevroNor). للحصول على معلومات مستكملة عن LFPy و الوثائق الفورية، راجع موقع LFPy (يتم تحرير http://compneuro.umb.no/LFPy).This البرنامج العلمي تحت رخصة جنو العمومية GPLv3.InstallationThere هي طريقة مختلفة لتثبيت LFPy: 1. من مؤشر حزمة بايثون مع فقط الوصول المحلي باستخدام نقطة نقطة تثبيت --user LFPy كما sudoer: سودو نقطة تثبيت LFPy2. من مؤشر حزمة بايثون مع الوصول المحلي فقط باستخدام easy_install easy_install --user LFPy كما sudoer: سودو easy_install LFPy3. من المصدر: القطران -xzf LFPy-x.x.tar.gz مؤتمر نزع السلاح LFPy-x.x (سودو) بيثون setup.py تثبيت (--user) زيارة المنتج
lfpy. برامج ذات صلة
