gfeatminer. التلاعب والإحصاءات حول البيانات الجينية
التحميل الان

gfeatminer. الترتيب والملخص

gfeatminer. العلامات

الإحصاء البيانات الجينومي البيانات الجينية إحصاءات الجينومية

gfeatminer. وصف

التلاعب والإحصاءات حول البيانات الجينية Gfeatminer هي وحدة نمطية بيثون التي يمكن اعتبارها إطارا للتعامل مع البيانات الجينية باستخدام نظام قائم على الطلب. عادة ما يكون المستخدم في إجهاده بعض الملفات التي تحتوي على بيانات جينية. هذه الملفات، والتي تتم إشرافها كمسارات، تحتوي على معلومات نوع الفاصل للجينوم (.bed، .gff) أو معلومات نوع النقاط الجينية (.wig). باستخدام وحدة Gfeatminer، يمكنه الآن حساب الإجابة بسهولة على الأسئلة التي تنطوي على إحصاء وصفية مثل: * ما هو توزيع الطول الميزات الموجودة داخل التحديد الذي قمت به؟ * ما هو توزيع النتيجة للميزات داخل هذه المسارات الثلاثة؟ * ما هي التغطية الأساسية التراكمية لهذه المسار 2 مقسمة من الكروموسوم؟ بالإضافة إلى وظيفة الوصول التي تنطوي على التلاعب الجينومي مثل: * توفير مسار جديد تم بناؤه من خلال دمج مسارين أخريين. * عرض الفواصل الزمنية المتداخلة اثنين من المسارات. * إنشاء مسار هو استكمال المسار الآخر. غالبا ما يبدو الاستخدام المسار آخر مثل هذا: # استيراد Gfeatminer # استيراد GMINER ك GM # إنشاء طلب # REQ = '' الإصدار = 0.1.0 Track1 = / TMP / A.SQL Track1_name = "Test Track 1" العملية_TYPE = التلاعب Genomic_manip = إخراج التكميل_إرسال = / TMP / النتيجة. إذا حدث خطأ! = 200: خطأ في الطباعة، النتيجة؛ خطأ SYS.EXIT () النتيجة، اكتب = job.run () إذا حدث خطأ! = 200: خطأ في الطباعة، النتيجة؛ SYS.EXIT () الوثائق الكاملة: يمكن العثور على الوثائق الكاملة في صفحة Wiki الخاصة بنا: http: //bbcf.pfl.ch/view/bbcf/gfeatminer متطلبات: بيثون

gfeatminer. برامج ذات صلة