التتبع
التحميل الان

التتبع الترتيب والملخص

التتبع العلامات

وحش محلل تتبع Bayesian MCMC. محلل بايزي LAMARC mrbayes

التتبع وصف

Tracer هو برنامج لتحليل ملفات التتبع التي تم إنشاؤها بواسطة Bayesian MCMC يعمل. Tracer هو برنامج لتحليل ملفات التتبع التي تم إنشاؤها بواسطة Bayesian MCMC يعمل (أي، وقيم المعلمة المستمرة أخذ عينات من السلسلة). يمكن استخدام المشروع لتحليل أشواط الوحش، Lamarc، Mrbayes وربما برامج MCMC الأخرى. يمكن استخدام Tracer الأخرى مع برامج أخرى غير الوحش، ينصح المستخدم بشدة بالانضمام إلى القائمة البريدية الوحش. سيتم استخدام هذا للإعلان عن إصدارات جديدة وتقديم المشورة للمستخدمين حول الأخطاء والمشاكل. يمكنك الانضمام إلى القائمة البريدية هنا: http: //groups.google.com/group/beast-usersthe الموقع الإلكتروني للوحش (والتتبع) هنا: http : //beast.bio.ed.ac.uk/at الحاضر لا يوجد دليل مفصل لهذا التطبيق، سوف تضطر ببساطة إلى اللعب ومعرفة ما يحدث. في الأساس يمكنك تحديد ملف التتبع في الجزء العلوي الأيسر من النافذة، والمعلمة الفردية في أسفل اليسار والتحليل تظهر على اليمين. هناك 4 علامات تبويب تحليل للاختيار من بينها: التقديرات - وهذا يدل على المتوسط، Stdev، الثقة الفواصل الزمنية والإحصاءات الأخرى حول المعلمة المحددة. سيتم أيضا توزيع التردد أيضا. الكثافة - وهذا يدل على مؤامرة الكثافة الخلفي بايزيا للمعلمة المحددة. مشترك هامشوي - يظهر هذا فقط في حالة اختيار 2 معلمات بالضبط (اضغط باستمرار على التحول لتحديد معلمات متعددة). ثم تتأرجح واحدا ضد الآخر للنظر في توزيعها الهامشي المشترك. تتبع - وهذا يدل على تتبع المعلمة ضد رقم الدولة أو الجيل. استخدم هذا للتحقق من الخلط، واختيار حرق مناسب وابحث عن الاتجاهات التي قد تشير إلى مشاكل مع التقارب. يمكن تحديد معلمات Multiple عن طريق الضغط باستمرار على مفتاح Shift. سيؤدي ذلك إلى تراكب المؤامرات لمعلمات مختلفة مما يسمح بإجراء المقارنات. يمكنك أيضا تحديد ملفات تتبع متعددة أيضا لمقارنة أشواط مختلفة. إذا كانت ملفات تتبع متعددة لها نفس أسماء النزورات، فسوف تظهر تتبع "مجتمعة" تلقائيا. يمكن اختيار ذلك بالإضافة إلى ملفات التتبع الفردية. يمكنك أيضا تحديد "التحليل الديموغرافي" من قائمة التحليل - هذه المؤامرات توزيع أحجام السكان الديموغرافي بمرور الوقت لعدد من النماذج (الحجم الثابت والنمو الأسي والنمو اللوجستي ) المتاحة في الوحش. هذا ينطوي على تحديد آثار لكل معلمة للنموذج. يجب عليك فقط تحديد النموذج الذي تم تشغيله فعليا بموجب الوحش (على سبيل المثال، إذا ركضت نموذجا للنمو الأسي، فلا يجب أن تخطط طراز حجم السكان المستمر). تحتوي قائمة "التحليل" أيضا على خيارات لأداء إعادة بناء أفق أفق بايزي و سيؤدي بحساب عوامل BAIES بين RWARDS.The وظيفة "الطباعة" في قائمة "الملف" سطباعة الرسم البياني أو الجدول الحالي ويمكن استخدام وظيفة "بيانات التصدير" لتصدير البيانات من المؤامرات للاستخدام في حزمة رسومات أخرى. للتصدير يستخدم الرسوم البيانية المعروضة حاليا وظيفة "تصدير PDF" في قائمة "الملف". الإبلاغ: بيئة وقت تشغيل Java (JRE) 1.5 أو ThereWhat جديد في هذا الإصدار: ميزات جديدة: توزيعات تراكب من مختلف الملفات والإحصائيات المزيد من السيطرة على التآمر تصدير الرسومات كأدوات الدفيئة والبيانات النيئة من معظم المشاهدات حساب عوامل بايز لمقارنة أشواط مع نماذج مختلفة تراكب إعادة التركيبات التركيبة بما في ذلك مؤامرات الأفق نقاط شفافة للمشتركة D الفضاء أسرع وأكثر دقة ESS Upaniesbugs ثابتة: هذا هو إعادة كتابة كاملة تقريبا حتى تكون جميع الأخطاء جديدة

التتبع برامج ذات صلة