NG-NEW. طريقة تعديل NEI-GOJOBORI لحساب المسافات المترادفة وغير الموفرة
التحميل الان

NG-NEW. الترتيب والملخص

NG-NEW. العلامات

تسلسل تسلسل الحمض النووي الحمض النووي النيوكليوتيد معدل غير محدد العثور على مسافات باتري المسافة مرادفة مسافة غير مجهولة المسافة غير المجهول الراديكالية استبدال مرادف. استبدال غير معروف طريقة عقلانية معدلة مرادف

NG-NEW. وصف

تم تطوير تطبيق NG-NEW أداة سطر الأوامر الصغيرة لتقدير المسافات المترادفة وغير المجهولية بين تسلسل بروتين ترميز الحمض النووي. يتم تعديل الطريقة من طريقة Nei and Gojobori الأصلية (1986) لمراعاة التحيز الانتقالي. لاستخدام البرنامج، تحتاج إلى ملف إدخال يحتوي على تسلسل بروتين ترميز الحمض النووي (انظر rnase.seq للحصول على مثال). يبدأ هذا الملف بأرقامين: عدد التسلسلات وعدد النيوكليوتيدات لكل تسلسل (طول التسلسل). سيكون السطر الثاني اسم التسلسل الأول، والسطر الثالث سيكون التسلسل الأول، وهلم جرا. يسمح فقط A، G، C، T، A، G، C، و T. يجب إزالة الثغرات وتتماشى التسلل مسبقا. يجب أن تتضمن التسلسلات فقط مناطق ترميز البروتين، مع إزالتها إيقاف الرموز.

NG-NEW. برامج ذات صلة