voroprot. أداة لتحليل ميزات هندسية بنية البروتين
التحميل الان

voroprot. الترتيب والملخص

voroprot. العلامات

بنية هندسة هندسي بروتين مرن هندسي هندسية تحليلية تحليل هندسي أداة النمذجة الهندسية شاشة الهندسية عرض هيكل البروتين عرض هيكل البروتين تحليل البروتين تحليل الهيكل مكتبة خطاباتيثريد الهندسية هيكل البروتين ميزات البروتين الهندسي تحليل بنك بيانات البروتين تحليل الجينات الترميز البروتيني استكشاف هيكل البروتين تحليل تسلسل البروتين تحليل أسر البروتين تحليل هيكل الدماغ تحليل هيكل دوري تحليل هيكل البيانات البروتين 3D هيكل

voroprot. وصف

القدرة على تحليل وتصور الميزات الهندسية بنية البروتين ثلاثي الأبعاد (ثلاثية الأبعاد) أمر أساسي لدراسات بروتين قابلة للطي، وتعبئة البقايا، وإرساء، وتفاعلات البروتين البروتين، إلخ. بعض هياكل البيانات الهندسية المتقدمة تجعل من الممكن أداء مثل هذا تحليل بطريقة شاملة. مع مراعاة هذا الهدف، قمنا بتطوير voroprot، أداة تفاعلية لتحليل الميزات الهندسية بنية البروتين. على وجه الخصوص، قررنا تقديم بعض الأساليب الهندسية، غير المدرجة في حزم البرامج الأخرى الأخرى. يبني VoriProt ويعرض مخطط Apollonius (المعروف أيضا باسم رسم مخطط Voronoi من المجالات) ورسم الرسم البياني Apollonius (المعروف أيضا باسم Delaunay Trangulation of Spheres) من ذرات البروتين، مع مراعاة كل ذرة أن تكون كرة ثلاثية الأبعاد من دائرة نصف قطرها Van Der Waals. VoroProt يستمد بروتين ذرات الاتصال الأسطح والأسطح التي يمكن الوصول إليها المذيب من مخطط Apollonius وتسمح بتصورها. بالإضافة إلى ذلك، يمكن العثور على تجاويف وعرضها داخل هيكل البروتين. لبناء مخطط Apollonius في VoroProt، استخدمنا تطبيق الخوارزمية الخاصة بنا، والتي يمكن تطبيقها ليس فقط عن ذرات البروتين، ولكن أيضا لأي مجموعة من النقاط أو المجالات ثلاثية الأبعاد. امنح voroprot محاولة تقييم قدراتها بالكامل!

voroprot. برامج ذات صلة