 | varscan.تحدد بسهولة SNPs مع هذا التطبيق |
| التحميل الان | |
varscan. الترتيب والملخص
الإعلانات
varscan. العلامات
varscan. وصف
Varscan هي أداة تستند إلى جافا مصممة خصيصا لتكون أداة منصة واستقلالية في التكنولوجيا لتحديد SNPs وإحصاءات في تسلسل متوازي على نطاق واسع للعينات الفردية والمجموعة. تعطى البيانات المعطاة لعينة واحدة، وتحدد Varscan وترشيح المتغيرات النارية بناء على عدد مرات القراءة والجودة الأساسية وتردد أليل. نظرا لبيانات الزوج العادي الورم، تحدد Varscan أيضا الحالة الجسدية لكل متغير (Germline أو الجسدية أو اللوح) من خلال مقارنة عدد مرات القراءة بين العينات. الخصائص الرئيسية: يدعو SNPs والمستندات من ملفات Samtools Pileup المرشحات المتغيرات عن طريق التغطية، وقراءة العمق، وتيرة البديل، ونوعية الأساس يحدد الوضع الجسدي (جبسسي، غرس، لوه) أزواج عادية ورم يقارن، يدمج، وتتقاطع اثنين من القوائم من المتغيرات يحد من مكالمات متغيرة إلى مجموعة من المناصب المستهدفة أو المناطق المستهدفة
varscan. برامج ذات صلة
