prottest. اختيار نماذج أفضل تناسب من تطور البروتين.
التحميل الان

prottest. الترتيب والملخص

prottest. العلامات

محاكاة لائق بدنيا بروتين محاكاة تطور تطور انتقام تحديد البروتين تبلور البروتين نقل البروتين حسن التلاؤم محاكاة التطور تحليل التطور تناسب تركيبات التحقق من صحة البروتين المنظم تطور الكائنات الحية تطور البروتين اختبار البروتين محاذاة البروتين الديمرية البروتينية هياكل البروتين البروتين بقايا متصفح البروتين عرض البروتين محاكاة تطور البروتين محاكاة تطور البروتين تطور متقاربة التطور الموازي تطور MKDV. تجعل البروتين إدارة بروتين بنك البيانات البروتين vizualizer.

prottest. وصف

Prottest (Modeltest's Lessation) هو برنامج لاختيار نموذج تطور البروتين الذي يناسب أفضل مجموعة معينة من التسلسلات (المحاذاة). النماذج المدرجة هي مصفوفات استبدال تجريبية (مثل Wag، LG، MTREV، DIAHOFF، DCMUT، JTT، VT، BLOSUM62، CPREV، RTREV، MTMAM، MTART، HIVB، و HIVW) تشير إلى معدلات استبدال الأحماض الأمينية، وتحسينات محددة (+ I: مواقع ثابتة، + G: معدل عدم التجانس بين المواقع، + F: ترددات الأحماض الأمينية الملحوظة) لحساب القيود التطورية المستحقة على الحفاظ على هيكل البروتين والوظيفة. يستخدم Prottest معيار معلومات Akaike (AIC) وإحصائيات أخرى (AICC و BIC) للعثور على أي من النماذج المرشحة تناسب البيانات بشكل أفضل. امنح محاولة لتقييم قدراتها بالكامل!

prottest. برامج ذات صلة