 | phylip.حزمة من البرامج لاستنتاج اللفيلين |
| التحميل الان | |
phylip. الترتيب والملخص
الإعلانات
phylip. العلامات
phylip. وصف
حزمة الاستدلال الفلسفي (PHILEIP) هي حزمة من البرامج لاستنتاج الأشجار التطورية (Phylogenies). تتضمن الطرق المتوفرة في الحزمة النزهة، مصفوفة المسافة، وأساليب الاحتمالات، بما في ذلك أشجار التمهيد والإجماع. تشمل أنواع البيانات التي يمكن التعامل معها على تسلسلات جزيئية وترددات الجينات ومواقع التقييد وشظاياها ومصفوفات المسافة والأحرف المنفصلة. يتم التحكم في البرامج من خلال قائمة، والتي تطلب من المستخدمين الذين يريدون تعيين خيارات، ويسمح لهم ببدء الحساب. تتم قراءة البيانات في البرنامج من ملف نصي، والذي يمكن للمستخدم الاستعداد باستخدام أي معالج نصوص أو محرر نصوص (ولكن من المهم أن يكون هذا الملف النصي في التنسيق الخاص لهذا المعالج النصي - يجب أن يكون بدلا من ذلك "Flat ASCII" أو "النص فقط" تنسيق). يمكن لبعض برامج تحليل التسلسل مثل برنامج محاذاة Clustalw كتابة ملفات البيانات بتنسيق Phylip. تبحث معظم البرامج عن البيانات الموجودة في ملف يسمى "Infile" - إذا لم يجدوا هذا الملف، فسيطلب من المستخدم كتابة المستخدم في اسم ملف ملف البيانات. يتم كتابة الإخراج على ملفات خاصة بأسماء مثل "Outfile" و "Outtree". الأشجار المكتوبة على "Outtree" هي في تنسيق Newick، وهو معيار غير رسمي متفق عليه في عام 1986 من قبل مؤلفين عدد من الحزم الرئيسية الفلسلة. احصل على Phylip وتعطيه محاولة لتقييم قدراتها بالكامل!
phylip. برامج ذات صلة
