pgdspider.
التحميل الان

pgdspider. الترتيب والملخص

pgdspider. العلامات

جينوم عدد السكان علم الوراثة علم الوراثة السكانية

pgdspider. وصف

بنيت Pgdspider باستخدام لغة برمجة Java كأداة لتحويل لبرامج الوراثة والجينات السكانية. يسهل البرنامج إمكانيات تبادل البيانات بين البرامج لمجموعة واسعة من أنواع البيانات (E.G. DNA، RNA، NGS، Microsatellite، SNP، بيانات RFLP، AFLP، بيانات متعددة الألواح، تردد أليل أو مسافات جينية). إلى جانب تنسيقات الوراثة السكانية التقليدية، يدمج PgsDSpider تنسيقات بيانات الجينوميات السكانية المستخدمة عادة لتخزين وتتعامل مع بيانات تسلسل الجيل التالي (NGS). حاليا، لا يقصد pgdspider تحويل ملفات NGS كبيرة جدا حيث يتم تحميلها في الذاكرة ملف الإدخال بأكملها، وقد يتجاوز حجم ذاكرة الوصول العشوائي المتاحة. ومع ذلك، نظرا لأن PgSDSpider يسمح للتحويل من مجموعات فرعية محددة من ملفات NGS هذه إلى أي تنسيق آخر، يمكن للمرء استخدام هذه الميزة لحساب المعلمات أو إحصائيات مناطق محددة، وبالتالي إجراء تحليل النافذة المنزلق على المناطق الجينية الكبيرة.

pgdspider. برامج ذات صلة