 | ngstools.أدوات لتحليل بيانات NGS |
| التحميل الان | |
ngstools. الترتيب والملخص
الإعلانات
ngstools. العلامات
ngstools. وصف
NGSTools هي حزمة قائمة على جافا تهدف إلى توفير نموذج كائن لتمكين أنواع مختلفة من تحليل بيانات التسلسل من الجيل التالي. تقدم الحزمة أيضا بعض برامج المرافق لمعالجة القراءات المحاذاة إلى الجينات المرجعية المختلفة. الأدوات الأكثر أهمية في هذه الحزمة هي SNVQ، والكشف عن النيوكليوتات النيوكليوتيد الدقيقة (SNV) من المكالمات الجينية من المكالمات الأساسية وعشرات الجودة ومجموعة قاعدة لتعيين دمج محاذاة القراءة إلى مكتبة نصوص CCDS مع محاذاة من نفس القراءات إلى مرجع الجمعية العامة. تنسيق الاختيار لمعالجة المحاذاة في كل أداة في هذه الحزمة هو SAM، والذي يسمح بدمج Ngstools باستخدام برامج تعيين شائعة الاستخدام باسم Bowtie وحزم التحليل الأخرى مثل Samtools.
ngstools. برامج ذات صلة
