mmass. تحميل مجاني ، mmass. تحميل على برنامج تحميل

يعرض البرنامج MMASS حزمة متعددة منصة مفتوحة من الأدوات البسيطة لتحليل بيانات الطيف الشامل. يتكون تطبيق MMASS في العديد من الوحدات والأدوات لمناولة تسلسل البروتين وتفسير الطيف الكتلي مع التركيز على المهام البروتيوية الشائعة. الخصائص الرئيسية: دعم تنسيق متعدد: يدعم MMASS العديد من تنسيقات الطيف الشامل، مثل MzData و MZXML. يمكن أيضا استيراد بيانات Spectra الجماعية أو بيانات الذروة بسهولة من ملفات ASCII البسيطة التي تتكون من أعمدة (قيم M / Z قيم كثافة) مفصولة بواسطة علامة تبويب أو مساحة وفاصلة أو فاصلة منقوطة. بالإضافة إلى ذلك، هناك دعم للبيانات الأصلية من أدوات Bruker Daltonic Series Flex الصكوك. واحدة من السمات الشعبية لممس هي القدرة على فتح مستند فارغ وإنشاء ذروة يدويا. هذه الميزة مفيدة بشكل خاص في تلك الحالات التي تتوفر فيها صورة الطيف أو القائمة المطبوعة من القمم المسمى فقط. معالجة البيانات: أخيرا، هناك وظائف معالجة مثل اختيار الذروة التلقائي، والتخلي عن التصحيح الأساسي والتنعيم. المعايرة: طريقتان متاحان لإعادة المعاملة. المعايرة الداخلية هي طريقة المعايرة الكلاسيكية، باستخدام القيم المرجعية الداخلية. قائمة واسعة من القيم المرجعية الداخلية متاحة ويمكن إضافة قيم جديدة بسهولة. المعايرة الإحصائية، التي تسمى أحيانا المعايرة الذاتية، هي طريقة خاصة متاحة ل Speptide Massra. لكلتا الطريقتين، يمكن استخدام التركيب الخطي أو التربيعي. أدوات التسلسل: يوفر MMASS محرر تسلسل داخلي، والتي يمكن استخدامها لإتاحة أي تسلسل بروتيني أو ببتيد وحدات أخرى. يمكن تطبيق أي تعديل إما ثابتا أو متغيرا. يمكن استخدام أداة Digest Protein لتوليد قائمة بالببتيدات الناتجة عن الهضم الأنزيمي أو الكيميائي في سيليكو من تسلسل البروتين المحدد. وبالمثل، تولد أداة تجزئة الببتيد قائمة من شظايا الببتيد الشائعة. في كلتا الحالتين، يتم احتساب جميع المجموعات الممكنة من التعديلات المتغيرة والنتيجة يمكن بسهولة مقارنة بالبيانات المقاسة. بالإضافة إلى ذلك، يمكن البحث في التسلسل عن كتلة الببتيد المحددة عن طريق أداة البحث التسلسل لتحديد الانقسام غير المحدد وغيرها. الآلة الحاسبة الشامل: يمكن استخدام أداة آلة حاسبة الكتلة لمحاكاة نمط النظائر من الصيغة المعينة ويمكن بسهولة مقارنة مع البيانات الحقيقية. مركب البحث: يمكن استخدام أداة البحث المركب للبحث عن أي مركب محدد من قبل المستخدم في الطيف. يتم تحديد كل مركب كصيغة جزيئية، وبالتالي يمكن أن يكون كل من الكتلة الأحادية أو المتوسطة يمكن البحث عن أي رسوم. بالإضافة إلى ذلك، يمكن البحث عن بعض المقود أيضا. اختلافات الذروة: تفسير الأطياف الكتلة عادة ما ينطوي عادة على فحص لا يبدو أنه لا ينتهي من الاختلافات بين جميع القمم في الطيف. ومع ذلك، فإن أداة الاختلافات الذروة قادرة على إنشاء جدول من جميع الاختلافات بين القمم في القمة. يمكن بعد ذلك استخدام هذا الجدول للقتال تلقائيا، ضمن عملية التسامح المحدد، كل فرق مع الجماهير المعنية لجميع الأحماض الأمينية أو Dipeptides المحسوبة أو القيمة الشامل المحددة. البحث عن التميمة: على الرغم من أن الطيف الشامل هو أداة شائعة جدا لتحديد البروتين، إلا أنها لن تكون ممكنة بدون الأدوات المتوفرة علنا عبر الإنترنت. يوفر MMASS واجهة تسمح بالبيانات المرسلة مباشرة إلى الأدوات الرئيسية الثلاثة المتاحة على موقع التميمة؛ الببتيد بصمات الأصابع، واستعلام التسلسل و MS / MS بحث أيون.

mmass. برامج ذات صلة