 | masschroq.برنامج قياس الكمي الكتلة |
| التحميل الان | |
masschroq. الترتيب والملخص
الإعلانات
masschroq. العلامات
masschroq. وصف
MassChroq هو أداة متخصصة ومتعددة الاستخدامات تؤدي الكمي على البيانات التي تم الحصول عليها من تقنيات الطيف المكتومات باللاملي السائل (LC-MS). يمكن أيضا استخدام Masschroq لأداء المحاذاة، وقطعات Xic والكشف عن الذروة. علاوة على ذلك، يمكن استخدام masschroq إلى: تحليل البيانات التي تم الحصول عليها من أنظمة مطياف عالية الدقة عالية ومنخفضة؛ تحليل البيانات المجانية على الملصقات وكذلك وصفتها (E.G. SILAC، ICAT، N-15، C-13، إلخ)؛ معالجة الوقت بكفاءة كمية كبيرة من العينات التي تم تحليلها بشكل مختلف في طلقة واحدة (من خلال تجميع عينات مماثلة وتقديم إمكانية تحديد تحليل كل مجموعة). تأخذ في الاعتبار علاجات البيانات المعقدة باعتبارها ببتيد أو تجزئة بروتينية قبل تحليل LC-MS (SCX، SDS-Page، إلخ)؛ الخصائص الرئيسية: تحليل تنسيقات بيانات MZXML و MZML LC / MS. الكمي من جميع الببتيدات المحددة للعينات و / أو قائمة معينة من القيم الشامل أكثر من القيم (M / Z) وقائمة معينة من (M / Z، وقت الاحتفاظ) أزواج القيم. يمكن دمج الببتيدات المحددة تلقائيا في تحليل MALLCHROQ باستخدام خط أنابيب Tandem الخاص بنا (الذي ينفذ تحديد وتصدير النتائج في تنسيق MassChroqml) أو عبر ملفات TSV (TAB SPECE) التي تحتوي على نتائج التعريف التي تم الحصول عليها من برنامج التعريف الآخر . طرق محاذاة متوفرة: يتم دمج محاذاة OBI-Warp التابعة لجهة خارجية بناء على بيانات MS المستوى 1 في Masschroq، ومحاذاة MS2 المتطورة الداخلية بناء على معلومات MS المستوى 2. يتم إجراء الكمي في masschroq على xics (romatograms مستخرج أيون): بعد استخراج Xic والتصفية، يتم الكشف عن القمم عليها باستخدام تحويلات مورفولوجية (انظر دليل المستخدم للحصول على التفاصيل). ثم يتم حساب مناطق الذروة (I.E. قيمة الكم) والحدود. يتم إجراء مطابقة الذروة (بعد المحاذاة إن وجدت) على النحو التالي: يتم تعيين ذروة المكتشفة إلى الببتيد المحدد إذا وفقط إذا كان وقت الاحتفاظ (المحاذاة) هذا الببتيد يقع داخل حدود الذروة. يمكن إجراء مطابقة الذروة في Masschroq في جولتين: أول واحد أثناء التصميم الكمي، وبمجرد الانتهاء من الكمي، يمكن للمستخدم إجراء جولة مطابقة ثانية محسنة محسنة، مع مراعاة أوقات الاستبقاء في القمم المتطابقة سابقا. مرشحات XIC المختلفة متوفرة: نقل المرشحات المتوسطة / المتوسط لتنعيم الإشارة والخلفية ومرشحات إزالة الضوضاء خط الأساس، مرشح مضاد للضوضاء لإزالة المسامير الناجمة عن بعض الطيف العالي الدقة، والمرشحات المورفولوجية، إلخ. يمكن للمستخدم تصدير النتائج في تنسيقات TSV و Gnumeric و XHTML وتنسيقات Masschroqml. إنها جاهزة للاستخدام الآلي في البرامج الإحصائية (مثل R) أو للاستكشاف اليدوي / البصري. تقييم MALLCHROQ على البيانات المجانية المعقدة التي يتم الحصول عليها بدون تسمية تم الحصول عليها من كل من مطياف الكتلة المنخفضة والعالية الدقة، سمحت بقياس السيرة الذاتية المنخفضة للاستنتاج التقني (1.4) ومعاملات عالية من الارتباط بكمية البروتين (0.98)
masschroq. برامج ذات صلة
