anc الجين استنتاج تسلسل الجينات الأجداد من خلال طريقة بايزيا القائمة على المسافة
التحميل الان

anc الجين الترتيب والملخص

anc الجين العلامات

تسلسل بايزي محرك الاستدلال جين نظام الاستدلال غامض تسلسل النوكليوتيد مشكلة الاستدلال الاستدلال الاختلافي محرر شبكة بايزي شبكة تحرير النظرية الافتراضية الإستنباط محاذاة بايزيان استنتاج النمط الفرداني أداة الاستدلال البيض البيانيون طريقة بايسيان التنفيذ طريقة بايسيان تحليل بايزي التحليل المستندة إلى المسافة الاستدلال الخلفي مجموعة الجينات الأجداد جين الأجداد الاستدلال الفلسفي كبير Bayesian MCMC تحليل تسلسل الجينات الاستدلال الإحصائي اسلاف

anc الجين وصف

تم تطوير تطبيق Jen-Gene ليكون أداة سطر الأوامر الصغيرة لاستدلال تسلسل نوكليوتيد الأجداد من جينات ترميز البروتين من مجموعة من تسلسلات الوقت الحاضر التي تعرف علاقاتها بالليسلوجين. يقوم البرنامج أولا بنتائج الأحماض الأمينية بطريقة Bayesian القائمة على المسافة، ثم تنتشر تسلسل النيوكليوتيد الأساسي من خلال إصلاح الأحماض الأمينية المتسلومة. لاستخدام البرنامج، تحتاج إلى ملف إدخال يحتوي على تسلسل الحمض النووي وطوبولوجيا الشجرة لهذه التسلسلات (انظر rnase.seq للحصول على مثال). يبدأ هذا الملف بأرقامين: عدد التسلسلات وعدد النيوكليوتيدات لكل تسلسل (طول التسلسل). سيكون السطر الثاني اسم التسلسل الأول، والسطر الثالث سيكون التسلسل الأول، وهلم جرا. يسمح فقط A، T، C، G، A، T، C، و G، في التسلسلات. يجب أن تكون التسلل محاذاة والفجوات أو إزالتها أي رموز أخرى. السطر الأخير من الملف هو طبولوجيا الشجرة للتسلسلات. شكل الشجرة هو نفسه الذي يستخدم في حزمة Phylip (Felsenstein 1995). لاحظ أن الشجرة غير مرتبطة، لذا فإن التوجيه بدلا من التصلح مطلوبة لأعمق عقدة المتفرعة.

anc الجين برامج ذات صلة