Sweblast. يقسم تسلسل الاستعلام، أو التسلسلات
التحميل الان

Sweblast. الترتيب والملخص

Sweblast. العلامات

استفسار يقسم تسلسل تسلسل HLA تسلسل النظام الحيوي تسلسل CRLF. تقسيم التسلسل تسلسل كروماتشاترام تسلسل قسامة تسلسل الاستعلام تقسيم التسلسل التسلسل القلث shader التسلسل تسلسل قاعدة البيانات تسلسل polypeptide. تسلسلات الانقسامات

Sweblast. وصف

Sweblast (انفجار النافذة المنزلق على شبكة الإنترنت) هو برنامج سطر الأوامر مكتوب في بيرل للاستخدام على Windows و Linux و Mac. سيتم تقسيم المكون الرئيسي من SWEBLAST.PL، تسلسل استعلام، أو تسلسل، يتم توفيره في تنسيق FASTA، في سلسلة من اللاحقة اللاحقة التي تم اختيارها وتداخلها، وترسل هذه التظليل على التوالي إلى منشأة الانفجار Genbank. يتم تجميع نتائج البحث في ملف واحد، Blast.txt، في مجلد فرعي. يتم تحليل ذلك بواسطة المكون الثاني، sweblast_parser.pl، والنتائج وضعت في مجلد فرعي كسلسلة من ملفات CSV التي سيتم فحصها باستخدام برنامج جدول بيانات قياسي، مثل Excel. لإلقاء نظرة على الحجج أو الخيارات المتاحة، يمكن للمرء تشغيل البرنامج باستخدام الخيار - Help perl sweblast.pl -help. -Help أو -H: إظهار هذه الرسالة. -POT أو -I: ملف الإدخال (البيانات). عند أو --O: مجلد الإخراج (اختياري). -Window أو -W: طول نافذة الافتراضي 100 (اختياري). الخطوة أو -s: طول الخطوة - الافتراضي 50 (اختياري). -Database أو -d: قاعدة البيانات Genbank المراد البحث - افتراضي NR (اختياري). -Program أو -p: برنامج لاستخدامه: Blastn، Blastp، BlastX - Default Blastn (اختياري). -إرسال أو -e: توقع (اختياري). -ENTREZ أو -Q: استعلام Entrez (اختياري) أمر Boolean للحد من البحث عن الانفجار (على سبيل المثال "الفيروس لا فيروس البطاطس Y "). -الصورة أو -r: للاتصال sweblast_parser.pl (اختياري). قطع أو -C: يتجاهل يضرب بقيمة إلكترونية أكبر (اختياري). أو استخدم القائمة التفاعلية عن طريق تشغيل البرنامج دون وسيطات واتبع المطالبة: بيرل sweblast.pl.

Sweblast. برامج ذات صلة