Simcoal. محاكاة التنوع الوراثي الجزيئي بمساعدة هذه الأداة.
التحميل الان

Simcoal. الترتيب والملخص

Simcoal. العلامات

- محاكاة محاكاة التغير الجيني الجهاز الوراثي المعلومات الوراثية التنوع تسلسل أداة البيولوجيا الجزيئية تحليل التنوع محلل التنوع تنوع محاكاة الديناميات الجزيئية تحليل التنوع الوراثي تحليل التنوع الوراثي التنوع الجيني محاكاة الخريطة الوراثية الوصول إلى التنوع الجينومي محاكاة التنوع الوراثي محاكاة التنوع الوراثي التنوع الوراثي الجزيئي السكان haploid محاكاة الطفرة الوراثية الجزيئية التمايز الوراثي

Simcoal. وصف

Simcoal هو تطبيق مفيد وسهل الاستخدام مصمم خصيصا لمساعدتك في محاكاة التنوع الوراثي الجزيئي في عدد التعسفي من السكان من السكان الذين تم فحصهم لمجموعة من Loci المرتبطة بالكامل. وهي تستند إلى نهج الكتل المنزلي بأثر رجعي وصفها في البداية من قبل Kingman (1982B؛ 1982A)، وعرضت بوضوح في سلسلة من الأوراق الأخرى (Ewens 1990؛ هدسون 1990؛ دونيلي و Tavar 1995). لا يحاكي النهج الخلف من الخفيفة التاريخ الجيني لجميع السكان، كما هو الحال في المحاكاة التقليدية للأمام، بل يعيد بناء الأنساب الجيني (التاريخ الفحلي) لعينات الجينات المستمدة من أعمال مختلفة في عدد السكان. بالنسبة للجينات المحايدة، تعتمد هذه العملية الفلافية بشكل أساسي على التاريخ وعلى ديموغرافيا السكان، وهي مستقلة عن العملية الطبية. هذا البرنامج محاكاة الطفرات التي تبدأ من أحدث سلف مشترك (MRCA) لجميع الجينات في العينة، وإضافتها بشكل مستقل عن جميع فروع الأنساب على افتراض عملية موحدة وثابتة. باستخدام نهج هذه الخطوة الخطية (طفرة خرافية)، يمكن محاكاة العديد من عينات Haploid من تسلسل الحمض النووي أو بيانات RFLP أو أو بيانات microsatellite بسرعة كبيرة. يتيح تحليل عدد كبير من العينات المحاكاة واحدة للحصول على التوزيع التجريبي لأي إحصائية عمليا يمكن اشتقاقها من البيانات الجينية، بما في ذلك الإحصاءات التي لا تتوفر أي اشتقاق تحليلي (هدسون 1993). تشمل التطبيقات النموذجية للبرنامج دراسة تأثير التركيبات المعقدة على نمط التنوع الوراثي داخل وبين السكان، كما هو الحال في حالة الاختناقات، والحالات المعقدة من أنظمة الخليط، أو أنظمة التقليم. في حين أن هذا التطبيق يولد عينات من الجينات أو النفايات الصلبية، يمكن إنشاء البيانات الصغيرة تحت فرضية توازن Hardy-Weinberg عن طريق تناول أزواج عشوائية من العبوات المملوكة لتشكيل الأنماط الوراثية الرقيبية

Simcoal. برامج ذات صلة