PeAkfinder. تحديد موقع قمم (مواقع تجليد Cohesin) في بيانات رقاقة الخميرة
التحميل الان

PeAkfinder. الترتيب والملخص

PeAkfinder. العلامات

مكتشف محدد تغيير البروتوكول عرض بروتوكول ملزم بروتوكول ملزم قمة حدد الربط التزلج ملزمة تنفيذ ملزمة رنديرمان ملزمة آلية ملزمة مرنة ربط البيانات ربط C ++ إلى LUA ملزمة إنشاء ملزمة توليد ملزم مكتبة ملزمة كيو تي 4 ملزمة صافي ملزم مجموعة ملزمة Twin قمم Screensaver. قمم التوأم OpenCL API Binding. ربط كيو تي ربط بيثون تحديد موقع الذروة العثور على الذروة بيك محدد عرض قمم الكروماتوغرافية تحليل قمم الكروماتوغرافي قاعدة بيانات API قمم ثلاثي جا نص الفسيفساء الخالق انخفاض حمض 1.0. N73 كتر النغمات تحميل متصفح تور إزالة USB بأمان Adobe Acrobat5 المسلسل Nero Plugin LAM. كاتب PHP NRG ملف النازع SIMS3PACK الجسم متجر سائق إيثرنت العالمي سائق بلوتوث IVT

PeAkfinder. وصف

تم تطوير تطبيق Peakfinder لتكون أداة تقوم بتوقيف قمم قمم (مواقع تجليد Cohesin) في بيانات ميكرواري رقاقة الخميرة (Chromatin Reconoprecipitation). PeakFinder هي أداة تصور جينوم تفتح بيانات نسبة MicroArray ل "قمم". تم العثور على القمم باستخدام منحنى سلس يمكن اختياره بشكل تفاعلي. يمكن عرض محتوى النيوكليوتيد باستخدام نافذة متحركة محددة جنبا إلى جنب مع نتائج MicroArray. البرنامج عام تقريبا لأي جينوم، ولكن لا يزال لديه عدد قليل من المعلمات الخميرة فقط. ملفات الإدخال: - ملف Genomeindex.dat: إحداثيات أخبر موقع كل كروموسوم داخل الجينوم. المحدد أيضا موقع Centromere. - "إحداثيات ميزة" ورقة عمل Excel: يجب أن تكون الأعمدة A و B و C. الإحداثيات هي إحداثيات جينوم لكل ميزة. - "نسب" ورقة عمل Excel مع بيانات MicroRay: العمود A يجب أن يكون "Iname". يفترض أن تكون بيانات النسبة في العمود الأخير. يجب أن تكون القيم "INAME" الميزة المحددة في ورقة عمل إحداثيات الميزة. - الدليل مع تسلسل النوكليوتيد، ملف واحد لكل كروموسوم. يمكن أن تكون بيانات التسلسل بتنسيق FASTA مع Defline، أو ببساطة ملف ASCII. يجب أن تكون أسماء الملفات Chr * أو Chrnn *. على سبيل المثال، chr05.fsa، أو chrviii_562639.ascii. إما تنسيق الملفات القديم أو "القديم" من قاعدة بيانات الجينوم Saccharomyces مقبولة. - Peakfinder.ini موجود في الدليل C: \ المستندات والإعدادات \ الإعدادات المحلية \ بيانات التطبيق \ StowersInstitute \ Peakinder ملفات الإخراج: - يتم وضع المخطط تلقائيا على الحافظة، إذا تم تحديد خيار الصورة النقطية أو ملف التعريف، ويمكن لصقها على الفور في أي تطبيق آخر بعد عرضه. (يؤدي إلغاء تحديد مربع تخطيط المخطط التلقائي إلى إيقاف هذا الوضع التلقائي للمخطط على الحافظة). خلاف ذلك، اضغط على الزر "حفظ" في طبقة طبقة الرسم البيانية لحفظ المخطط إلى ملف GIF محدد. - يمكن تحديد زر حفظ قمم على قمم Tabsheet بحفظ ملف Peaks.csv، والذي يمكن فتحه في Excel. - يقوم الزر "عملية" كل "على RAWDATA Tabshet في مجموعة من الملفات التي يتم إنتاجها. حدد عادة دليل جديد وسوف يحتوي على هذه الملفات عند اكتمال المعالجة: RatioFilename.dat، RatioFilename-Chromosomenn.gif (NN = 01 إلى 16)، و RatioFilename-Peaks.csv، حيث Ratiofilename هو اسم النسبة Excel الملف المحدد في طبقة بيانات البيانات الأولية.

PeAkfinder. برامج ذات صلة