 | PPH.برنامج لاستنتاج النيبات المملوكة من الأنماط الجينية |
| التحميل الان | |
PPH. الترتيب والملخص
الإعلانات
PPH. العلامات
PPH. وصف
تم تطوير PPH ليكون برنامجا لاستنتاج النيبات المملوكة من الأنماط الجينية لتحديد ما إذا كانت هناك نماذج تلبية تناسب نموذج شجرة (I.E. في المزيد من المصطلحات الوراثية السكانية، يحدد PPH ما إذا كان يمكن تفسير مجموعة من الأنماط الوراثية SNP بواسطة أزواج النمط النمطية التي يمكن أن تطورت على منفجا تحت مواقع عدم التعرجة، نموذج المواقع اللانهائية. وبالتالي، فإنه يحدد بيانات النمط الوراثي SNP ما اختبار SNP أو أربعة أشماج (اعتمادا على ما إذا كانت الشجرة متجذرة أم لا) تحدد بيانات Haplotype. في البرنامج PPH، عندما سئل عن تنسيق بيانات الإدخال، حدد أحد الأرقام من 1 إلى 7 كما هو موضح أدناه. يحدد تنسيق الإدخال تنسيق الإخراج. خطوة بخطوة لاستخدام هذا البرنامج: 1. اكتب "pph.exe" لبدء البرنامج. 2. يرجى إدخال اسم الملف: أدخل اسم ملف الملف الذي يحتوي على معلومات عن النمط الوراثي أو Haplotype. 3. يرجى إدخال عدد تنسيق الملف: (يرجى الرجوع إلى الملف "format.txt"): يمكن لهذا البرنامج قراءة سبعة أنواع مختلفة من التنسيقات. يرجى الرجوع إلى الملف "format.txt" لمزيد من المعلومات من التنسيقات. يجب أن تكون قيمة الإدخال من 1 إلى 7. 4. يرجى إدخال اسم الملف الذي يحمل ناقلات الأجداد، أي ناقلات ثنائي تحدد حالات الشخصيات في جذر الشجرة. هناك حالتان خاصتان لهما أهمية خاصة. إذا كانت دول الأجداد كلها جميعا، فما عليك سوى إدخال "D" للحالة الافتراضية؛ إذا كنت لا تعرف حالات الأجداد، فأدخل "M" لنطق الأغلبية). في هذه الحالة، سيحدد البرنامج ما إذا كانت هناك شجرة غير محرومة يمكن أن تتطور الأنماط الوراثية المحددة. 6. سيتم إنشاء ملف إخراج. اسم ملف الإخراج هو "الإخراج". للحصول على معلومات حول تنسيقات الإخراج، راجع تنسيق الملف 7. يتحقق البرنامج أيضا من اتساق الإخراج. وهذا هو، فإنه يتحقق من أن كل زوج Haplotype الناتج يتوافق بالفعل مع ناقلات النمط الوراثي المدخل الصحيح. يبلغ البرنامج عن نتيجة خطوة التحقق.
PPH. برامج ذات صلة
