JModeltest. مكتبة نموذج Phylogenetic
التحميل الان

JModeltest. الترتيب والملخص

JModeltest. العلامات

منظم phylogenetic. الاستبدال النيوكليوتيد تحليل النشوء والتطور محلل النشوء والتطور البصمة التطورية السياق التطوري phylogenetic. تحقق التحقيق phylogenetic. المدقق التحقيق phylogenetic اختبار التحقيق phylogenetic. حساب شبكة phylogenetic. استبدال النيوكليوتيد نموذج Phylogenetic المتوسط نموذج النشوء والتطور تخزين شبكة phylogenetic. تحليل البيانات phylogenetic. بيانات phylogenetic بخس المهمة التطورية تحليلات phylogenetic. بناء supertrees phylogenetic. إنشاء supertrees phylogenetic. اختبار الاستقلال phylogenetic. تحليل نموذجي نموذجي فرضية phylogenetic. العلاقة التطورية إعادة إعمار phylogenetic. طوبولوجيا phylogenetic. مولد phylogenetic. ذروة المتوسط

JModeltest. وصف

JModeltest هو تطبيق علمي يمكنه إجراء مجموعة مختارة من بدائل النيوكليوتيد، مفيدة لتحليل الحمض النووي، بدعم من الحزم الكبيرة من البيانات. إنه مشروع مفتوح المصدر، وهو مشروع مستعد للطلاب والمعلمين، فضلا عن الباحثين في حقل الحمض النووي. ومع ذلك، يتم معظم التحليل تلقائيا، ومع ذلك، من المتوقع أن تكون المعرفة النيوكليوتيد المتقدمة من المستخدم، معظمها لتفسير النتائج. يعتمد JModeltest على بيئة وقت تشغيل Java لتشغيله بنجاح، ولكن هذا هو التبعية الوحيدة التي تحتاجها لتوفيرها. لأنه يأتي ملفوفا داخل حزمة محمولة، وبالتالي فإن التثبيت غير مطلوب. واجهة JModeltest بسيطة إلى حد ما، ولكن الوظائف المضمنة داخلها هي ذات طبيعة أكثر تعقيدا. يمكن أن تكون معظم واجهة المستخدم الرسومية لتحليل البيانات والتقارير التي تنجم عن هذه العملية، والتي، اعتمادا على المعلومات الواردة داخل الملف المصدر، يمكن أن تكون طويلة جدا. هناك خمس استراتيجيات اختيار مختلفة ويتم تضمينها داخل قائمة التحليل، على النحو التالي: AIC (معيار معلومات Akaike)، BIC (معيار معلومات Bayesian)، DT (نظرية القرار)، HLRT (اختبارات نسبة احتمالية التسلسل الهرمية) والمتوسط البيولوجي. يمكن تكوين كل هذه قبل عملية التحليل الفعلي؛ على سبيل المثال، يمكنك ضبط فاصل الثقة أو تعيين التطبيق لإجراء متوسط نموذجي. لإيقاف تشغيله، يمكنك أيضا توجيه البرامج للقيام بحسوبة درجة احتمالية تعتمد على اختلاف معدل تخصيص ونموذج شجرة قاعدة محددة مسبقا. في الختام، يمكن ل JModeltest أن ينقذ الزمن والجهد سيستثمر العلماء في إجراء عمليات تحليل الحمض النووي من خلال الوسائل التقليدية. ومع ذلك، فمن المستحسن أن يتم التحقق من النتائج بدقة، فقط في حالة. تم التقييم بواسطة Andreea Matei، آخر تحديث في 17 أغسطس 2014

JModeltest. برامج ذات صلة