Haploview. جعل تحليل النمط النمط بسهولة.
التحميل الان

Haploview. الترتيب والملخص

Haploview. العلامات

التحليلات - اختبار تقدير Haplotype تقدير Haplotype. Haplotype المشترك ارسم المصبات الطلاء النمط الفرداني النمط الفرداني شجرة النمط الفرداني استنتاج النمط الفرداني وصف Haplotype. تسلسل للنايب تحليل النمط تحليل كتلة Haplotype. اختبار جمعية Haplotype جمعية النمط الفرداني بيانات Haplotype. Y--Chromosomal Haplotype

Haploview. وصف

تم تصميم تحليل Haplotype للاختبار الوراثي الجزيئي من أجل تحديد شرائح الحمض النووي التي تشترك في أوجه التشابه. تم إنشاء Haploview لتحسين المهام المتعلقة بهذا التحليل. التطبيق يعتمد على جافا، مما يجعلها منصة عبر النظام الأساسي وليس هناك حاجة إلى الذهاب من خلال عملية التثبيت. تنسيقات الملفات والخلف غير بسيطة ولوحة واحدة، مع لوحة واحدة تقبل تحميل ما يصل إلى خمسة ملف التنسيقات: الربط القياسي، مقالب البيانات من مشروع Hapmap، المرحلة أو البلغم. هناك أيضا دعم تحميل ملفات متعددة عن طريق تطبيق سطر الأوامر "-Batch". بغض النظر عن تنسيق الملف المختار محمل في التطبيق يمكن تخصيص نفس المعلمات. تشير هذه إلى مقارنة الزوجية للعلامات، والتي يمكن أن تكون أعلى من القيمة المحددة للمستخدم (يتم تعيين الافتراضي إلى 500 كيلو بايت). تشير المعلمة الثانية إلى كمية الأنماط الوراثية المفقودة في الأفراد. اعتمادا على قيمة مجموعة المستخدمين، يمكن استبعاد هؤلاء الأفراد من التحليل. تتوفر إعدادات التكوين الإضافية لبعض تنسيقات الملفات المدعومة. في حالة وجود مستخدمي الربط القياسي لديهم إمكانية تمكين اختبار الارتباط أو بيانات Trio العائلية أو تحميل ملف اختبار. بعد تحميل هذا الملف، هناك العديد من العروض المتوفرة، والتي تشمل مؤامرة LD أو HapLotypes أو علامات الاختيار أو Tagger (تجمع بين أساليب الزوجية مع الكفاءة المحتملة مناهج متعددة الأمواج). مع تنسيق المرحلة، يمكن تنزيل مسار معلومات Hapmap إذا كان هناك اتصال بالإنترنت. الوظائف يمكن استخدام البرنامج لتشغيل تحليل LD و Haplotype وكذلك تقدير تردد النمط المفرط في السكان. تدعم قائمة الوظائف أيضا اختبار التقليب الذي قد يكشف أهمية الرابطة. Fultionhaploview هو برنامج مع التطبيقات العلمية التي تدعم العديد من المهام المتعلقة بعملية تحليل النمط. يمكن استخدامه من قبل الطلاب على دراية بالموضوع وهو مرن أيضا من حيث الوظائف وسهولة الاستخدام. المراجعة بواسطة ايونت إيلاسكو، آخر تحديث في 7 مارس 2014

Haploview. برامج ذات صلة