GZ-Gamma.

تقدير العدد المتوقع من بدائل كل موقع حمض أميني
التحميل الان

GZ-Gamma. الترتيب والملخص

الإعلانات

  • Rating:
  • رخصة:
  • Freeware
  • اسم الناشر:
  • Jianzhi Zhang
  • حجم الملف:
  • 133 KB

GZ-Gamma. العلامات


GZ-Gamma. وصف

تم تطوير GZ-GAMMA لتقدير العدد المتوقع من البحث عن موقع كل حمض أميني (Nucleotide)، ومعلمة شكل جاما للاختلاف في الأسعار بين المواقع، باستخدام مزيج من استنتاج تسلسل الأجداد والحد الأقصى لتقدير احتمالية عند العلاقات الفلسلة بهذه العلاقات متتسلسلة متماثلة معروفة. تحتوي هذه الحزمة على برنامجين: GZ-AA.EXE لتسلسلات الأحماض الأمينية، و GZ-DNA.EXE للحصول على تسلسل الحمض النووي، والتي يتم ترميزها في لغة C. لاستخدام البرنامج، تحتاج إلى ملف إدخال واحد يحتوي على تسلسل الأحماض الأمينية (أو النيوكليوتيد) وطوبولوجيا الشجرة لهذه التسلسلات (انظر ATP6.aa للحصول على مثال). يبدأ هذا الملف بأرقامين: عدد التسلسل وعدد من مواقع الأحماض الأمينية أو النيوكليوتيد (طول التسلسل). سيكون السطر الثاني اسم التسلسل الأول، والسطر الثالث سيكون التسلسل الأول، وهلم جرا. يجب أن يشغل كل تسلسل خطا دون أي انقطاع. يسمح فقط الحروف (المجمعة) للأحماض العشرين (أو 4 Nucleotides) في التسلسلات. يجب إزالتها الفجوات أو أي رموز أخرى بالفعل. السطر الأخير من الملف هو طبولوجيا الشجرة للتسلسلات. تنسيق الشجرة هو نفسه الذي يستخدم في حزمة Phylip. لاحظ أن الشجرة غير مرتبطة، لذلك يلزم التوجيه بدلا من الاستواء لأعمق عقدة المتفرعة


GZ-Gamma. برامج ذات صلة

يجمع

الجمع بين مجموعات البيانات متعددة في تحليل احتمالات ...

283 440 KB

تحميل