ينبع تقدير شجرة الأنواع باستخدام الحد الأقصى احتمال
التحميل الان

ينبع الترتيب والملخص

ينبع العلامات

التحليلات تقدير التكاليف تقدير تقدير الوقت تقدير الحركة أقصى CFF3 التقدير أنواع جين أنواع الطيور تقدير البرمجيات تقدير المعلمة تقدير التباين أنواع cetacea إنشاء الأنواع توليد الأنواع تقدير FDR. تقدير Haplotype شجرة الأنواع مراقبة الأنواع تقدير الأداء خالق التقدير تقدير التناضح احتمالية التسلسل الهرمي تقدير شجرة phylogenetic. تقدير المعلمات النموذجية تقدير كبير الفيسيني تقدير الجهيلات الكبيرة طول الفرع شجرة الجينات تقدير الأشجار أليل الاحتمالية القصوى تقدير القناة تقدير الجهود تقدير الطباعة أقصى LinkDepth.

ينبع وصف

تم تطوير الجذع ليكون برنامجا لاستنتاج أشجار أنواع الاحتمالات القصوى من مجموعة من أشجار الجينات المقدرة تحت النموذج الوحشي. سيعود البرنامج إما شجرة ML بالضبط، أو حساب احتمال وجود شجرة محددة من قبل المستخدم، أو ابحث عن مجموعة من أعلى أشجار احتمالية. طريقة البحث في مساحة الأشجار هي خوارزمية صلب محاكاة. الجذعية تتطلب عدة مدخلات في ليه. RST من هذه هي فاي LE الذي يعطي المعلومات لأشجار الجينات، التي يجب أن تسمى genetrees.tre. يحتوي هذا le le على أشجار الجينات بأطوال فرع بتنسيق Newick. يجب أن تكون أشجار الجينات متجذرة ويجب أن تلبي الساعة الجزيئية، على الرغم من أن البرنامج لن يتحقق من ذلك (من المرجح أن تحصل على خطأ أو سيتم تشغيل Inde بشكل غير صحيح إذا لم يكن هذا هو الحال). مباشرة أمام كل شجرة جين هي رقم داخل الأقواس المربعة التي تعطي مضاعف معدل لكل جين.

ينبع برامج ذات صلة