 | هلبرنامج كمبيوتر ينفذ تركيب نموذج |
| التحميل الان | |
هل الترتيب والملخص
الإعلانات
هل العلامات
هل وصف
تم تطوير WHS ليكون برنامجا كمبيوتر ينفذ تركيب نموذج يسمى نموذج الأنواع نموذج العزلة، وهو واحد دون تدفق الجينات. مع بيانات تسلسل الحمض النووي المقارن من كل نوع من النوعين المرتبطين وثيقا، تتيح الطريقة تقدير الوقت منذ الأنظمة وحجم أنواع الأجداد. ينفص نموذج العزلة ما يلي: - اثنان من النوعين، أو السكان، التي تم أخذ عينات منها البيانات، من أنواع أجداد واحدة، أو عدد السكان، بعض الوقت، أجيال تي، في الماضي. - الأنواع الأجداد المشتركة، أو السكان كانت ذات حجم فعال ثابت. - أنواع الدرسلتين (السكان) لديها أحجام فعالة ثابتة N1 و N2، على التوالي. - باستثناء لحظة الفصل السكاني في الوقت المناسب، فإن أحجام السكان ثابتة. - منذ فصل السكان، هناك تدفق جين صفر بين الأنواع (السكان). - جميع الطفرات محايدة. يجب أن يقيم ملف البرنامج إما في نفس المجلد مثل ملف البيانات أو في مجلد يبحث تلقائيا عن طريق نظام التشغيل. يمكن تشغيل البرنامج باستخدام معلمات سطر الأوامر، أو ببساطة عن كتابة اسم البرنامج (WH '). إذا لم يتم استخدام معلمات سطر الأوامر، فإن البرنامج يسأل عن قيم معلمات وقت التشغيل. يبدأ المستخدم في البرنامج ببساطة عن طريق الانتقال إلى المجلد حيث يوجد ملف البيانات وكتابة اسم البرنامج (E.G. "المواقع") متبوعا بمفتاح ENTER. يطلب البرنامج عدة أسئلة حول ملف البيانات والتحليل المرغوب فيه. يمكن أيضا إدخال جميع الأوامر والخيارات تقريبا باستخدام معلمات سطر الأوامر. يمكن بدء تشغيل البرنامج أو بدون استخدام التعليمات في سطر الأوامر. بدون تعليمات سطر الأوامر - ببساطة اكتب "WH" في المطالبة. سيطلب البرنامج المعلومات الأساسية. على PowerPC، يفتح أيقونة البرنامج نافذة صغيرة يمكن فيها إدخال معلمات سطر الأوامر. يمكن للمستخدم أيضا ضرب العودة في هذه المرحلة، وسوف يطلب البرنامج معلمات وقت التشغيل. معلمات سطر الأوامر: اكتب وأدخلها WH-D'datafilename '-R'Resultsfilename' -N'numsims '- l'ldtype' -aRanseed ' أين: "DataFilename" هو اسم ملف بيانات موجود في نفس المجلد مثل البرنامج 'resultsfilename' هو اسم الملف الذي سيتم إنشاؤه لاحتواء النتائج. سيتم إنشاء ملف النتائج بامتداد ".WH" "Numsims" هو عدد صحيح من عدد المحاكاة التي يجب تشغيلها. لا يتطلب تركيب النموذج الأساسي المحاكاة. إذا كانت هذه القيمة ليست صفرية أو فارغة، يجب أن يكون لملف البيانات المعلومات اللازمة في معدلات إعادة التعرية. "LDTYPE" يحكي البرنامج ما نوع قيمة عدم توافق الربط لحساب. يتطلب هذا الخيار إجراء عمليات المحاكاة، وأن ملف البيانات يتضمن معلومات حول إعادة التركيب وقيم LD الملاحظة. "LDTYPE" يجب أن تتوافق مع مقياس عدم التوافق في الارتباط المستخدم لإنشاء DataFile. يمكن أن يستغرق "LDTYPE" القيم التالية: "ص" يستدعي معامل الارتباط "استدعاء" R ^ 2، مربع معامل الارتباط "د" يستدعي قياس عدم التوافق الأساسي يستدعي "p" D 'الذي يساوي D / DMAX، حيث DMAX هو الحد الأقصى لقيمة ممكنة لل D تعطى ترددات Allele الملاحظة. "ب" تستدعي القيمة المطلقة لل D، | D | "Ranseed" هي بذرة رقمية رقم عشوائي وغير مطلوبة بشكل عام ما لم يكن المستخدم يريد تكرار المحاكاة بالضبط.
هل برامج ذات صلة
