محاذاة إحصائية سريعة لينكس

FSA هو خوارزمية محاذاة متعددة التسلسل متعددة الاحتمالات.
التحميل الان

محاذاة إحصائية سريعة لينكس الترتيب والملخص

الإعلانات

  • Rating:
  • رخصة:
  • Freeware
  • اسم الناشر:
  • Robert Bradley
  • موقع ويب الناشر:
  • أنظمة التشغيل:
  • Linux
  • حجم الملف:
  • 7.25MB

محاذاة إحصائية سريعة لينكس العلامات


محاذاة إحصائية سريعة لينكس وصف

الإعلانات المحاذاة الإحصائية السريعة لنظام Linux هي برامج منزلية وتعليم طورتها روبرت برادلي. بعد محاكمتنا واختبارنا، ثبت أن البرنامج هو رسمي وآمن ومجاني. فيما يلي الوصف الرسمي للمحاذاة الإحصائية السريعة لنظام التشغيل Linux: FSA عبارة عن خوارزمية محاذاة متعددة التسلسلات الاحتمالية والتي تستخدم نهج "القائمة على المسافة" لمحاذاة البروتين التجاذي أو الحمض النووي الريبي أو تسلسل الحمض النووي. وكثير من أساليب إعادة الإعمار الفيستية المستندة إلى المسافة مثل الانضمام إلى الجيران بناء على ما يلزم من تقديرات الاختلاف الزوجية فقط، فإن FSA يبني محاذاة متعددة باستخدام تقديرات الزوجية فقط من التماثل. هذا ممكن من خلال تقنية الصلب التسلسل لبناء محاذاة متعددة من مقارنات الزوجية. يجلب FSA الدقة المرتفعة المتوفرة مسبقا فقط للتحليلات الصغيرة من البروتينات أو RNAS إلى مشاكل واسعة النطاق مثل محاذاة الآلاف من التسلسلات أو التسلسلات الطويلة الميغاباسي. تقدم FSA عدة طرق جديدة لبناء محاذاة أفضل: يستخدم FSA تقنيات لتعلم الآلات لتقدير الفجوة ومعلمات الاستبدال على الطاير لكل مجموعة من تسلسل الإدخال. إن طريقة محاذاة "التعلم الخاصة بالاستعلام" تجعل FSA قوية للغاية: يمكن أن تنتج محاذاة متفوقة من مجموعات من التسلسلات المتماثلة التي تخضع لقيود تطورية مختلفة للغاية. FSA قادر على محاذاة المئات أو حتى الآلاف من التسلسلات باستخدام خوارزمية الاستدلال العشوائية لتقليل التكلفة الحسابية لمحاذاة متعددة. يمكن أن يكون هذا الاستنتاج العشوائي أكثر من عشر مرات أسرع من نهج مباشر مع فقدان القليل من الدقة. يمكن ل FSA بمحاذاة تسلسل طويل جدا باستخدام تقنية "مرساة الصلب" لحل المراسين وتسهيلها بمثبتين متعددي. ثم يغرز معا المحاذاة بين المراسي باستخدام الأساليب الموصوفة أعلاه. يمكن أن تعرض واجهة المستخدم الرسومية المشمل، المجنون (شاشة المحاذاة المتعددة)، المحاذاات الوسيطة التي تنتجها FSA، حيث يتم ملونة كل حرف وفقا لاحتمال محاذاة بشكل صحيح


محاذاة إحصائية سريعة لينكس برامج ذات صلة

maquarium

maquarium هو برنامج إدارة حوض السمك للمبتدئين أو حارس الأسماك الخبراء ...

1 1.2MB

تحميل