فونزي ابحث عن علامات مع هذه الأداة
التحميل الان

فونزي الترتيب والملخص

فونزي العلامات

علامة رسم الخرائط علم الوراثة

فونزي وصف

Fonzie هو تطبيق معلوماتية مقرها بيثون تم إنشاؤه في تخصص الخرائط الوراثية. يسمح لك Fonzie بإيجاد علامات على مجموعة من التسلسلات وربط Oligonuclecleotides أيضا. يدعو Fonzie جنبا إلى جنب كرر مكتشف على ملف التسلسل النووي الإدخال (تنسيق FASTA). يتم فحص كل علامة بشأن معايير مختلفة (الحجم، النسبة المئوية للمطابقات، وجود في مناطق محددة من تسلسل الإدخال). بعد ذلك، يتم إنشاء حساسية علامة من خلال أداء انفجار على قاعدة بيانات للتسلسل النووي (والتي تشمل ملف الإدخال). يجب إنشاء قاعدة البيانات هذه قبل استخدام Fonzie. في الخطوة التالية، تم تصميم أزواج التمهيدي، باستخدام Primer3، للعلامات المحددة. ثم اختبار Fonzie حساسية منتج التضخيم باستخدام الانفجار ضد قاعدة البيانات. ملفات إخراج Fonzie هي ملف نصي محدد في علامة التبويب، بما في ذلك البيانات على علامات ويقطر، ملف DAT هو إخراج TRF و 3 أدلة تحتوي على التوالي، تسلسل العلامة في FASTA، تسلسل منتج التضخيم في FASTA وملف البيانات لكل علامة.

فونزي برامج ذات صلة