سلف استنتاج تسلسل الأحماض الأمينية الأجداد من خلال طريقة بايزيا المسافة
التحميل الان

سلف الترتيب والملخص

سلف العلامات

تسلسل بايزي محرك الاستدلال نظام الاستدلال غامض العثور على الأحماض الأمينية مكتشف الأحماض الأمينية بحث عن الأحماض الأمينية محلل الأحماض الأمينية تسلسل الحمض الأميني حمض أميني مترجم حمض الأميني مشكلة الاستدلال استخراج الأحماض الأمينية الاستدلال الاختلافي محرر شبكة بايزي شبكة تحرير النظرية الافتراضية الإستنباط استنتاج النمط الفرداني أداة الاستدلال phylogenetic. البيض البيانيون طريقة بايسيان التنفيذ طريقة بايسيان بقايا الأحماض الأمينية التحليل المستندة إلى المسافة الحمض الأميني الأمثل الاستدلال الخلفي مجموعة الجينات الأجداد جين الأجداد تحليل الأحماض الأمينية تحليل زوج الأحماض الأمينية الأحماض الأمينية تحليل زوج الاستدلال الفلسفي كبير تحليل تسلسل الأحماض الأمينية تحليل تسلسل الأحماض الأمينية تصنيف الأحماض الأمينية طوبولوجيا الأحماض الأمينية طوبولوجيا الشجرة كاشف أميني حمض كشف الحمض الأميني تحليل سلسلة الأحماض الأمينية اسلاف

سلف وصف

تم تصميم تطبيق الجد لاستنتاج تسلسل الأحماض الأمينية للأجداد من مجموعة من تسلسل الأحماض الأمينية المتماثلة التي تعرف علاقاتها الفلسلة. تحتوي هذه الحزمة على برنامج واحد: Ancestor.exe، المكتوبة باللغة C. لاستخدام البرنامج، تحتاج إلى ملف إدخال يحتوي على تسلسل الحمض الأميني وعلم الأشجار لهذه التسلسلات (انظر lysozyme.aa للحصول على مثال). يبدأ هذا الملف بأرقامين: عدد التسلسلات وعدد مواقع الأحماض الأمينية (طول التسلسل). سيكون السطر الثاني اسم التسلسل الأول، والسطر الثالث سيكون التسلسل الأول، وهلم جرا. يسمح فقط رمز حرف واحد فقط (رسميا) للأحماض الأمينية العشرين في التسلسلات. يجب أن تكون التسلل محاذاة وثفامات أو تتم إزالة أي رموز أخرى بالفعل. السطر الأخير من الملف هو طبولوجيا الشجرة للتسلسلات. شكل الشجرة هو نفسه الذي يستخدم في حزمة Phylip (Felsenstein 1995). لاحظ أن الشجرة غير مرتبطة، لذلك يلزم التوجيه بدلا من الاستواء لأعمق عقدة المتفرعة

سلف برامج ذات صلة