 | ربطة لينكسربطة لينكس هو محاذاة قصيرة فائق الكفاءة في القراءة |
| التحميل الان | |
ربطة لينكس الترتيب والملخص
الإعلانات
- رخصة:
- Freeware
- اسم الناشر:
- Ben Langmead
- موقع ويب الناشر:
- أنظمة التشغيل:
- Linux
- حجم الملف:
- 13.40MB
ربطة لينكس العلامات
ربطة لينكس وصف
الإعلانات Bowtie for Linux هو برنامج للمنزل والتعليم الذي طوره بن Langmead. بعد محاكمتنا واختبارنا، ثبت أن البرنامج هو رسمي وآمن ومجاني. هنا هو الوصف الرسمي ل Bowtie لنظام التشغيل Linux: تحرير بواسطة ربطة لينكس هو فائق السرعة، وقراءة قصيرة كفاءة الذاكرة أليجنر. تقوم بمحاذاة تسلسل الحمض النووي القصير (يقرأ) إلى الجينوم البشري بمعدل 25 مليون يقرأ في الساعة في محطة عمل نموذجية مع غيغابايت من الذاكرة. مؤشرات ربطة الجينوم مع مؤشر الجحور-ويلر للحفاظ على بصمة الذاكرة الصغيرة: 1.3 GB للجينوم البشري. وهو يدعم سياسات المحاذاة معادلة MAQ والصابون ولكن أسرع بكثير: حوالي 35x أسرع من MAQ وأكثر من 350x أسرع من الصابون عند محاذاة الجينوم البشري. سمات: إصلاح جميع المشكلات المعروفة مع خيارات --UNFA / - الخدم: أنها تعمل الآن بشكل صحيح مع خيوط متعددة. مشكلة ثابتة حيث تم عكس التسلسل والاستشرات في بعض الأحيان. قضايا أخرى ثابتة تسبب الإغفال الزائفي من القراءات غير المعرفة. تمت إضافة خيارات - Maxfa / - Maxfq خيارات حتى لا يتم إلقاء القراءات التي لا تتماشى بسبب الحد -M الحد بشكل منفصل عن القراءات التي لا تتماشى على الإطلاق. مكفول إخراج المحاذاة الآن أن تكون "حتمية" حتى عند استخدام مؤشرات ترابط متعددة. أي، بالنظر إلى نفس المدخلات يقرأ (في أي ترتيب) وسوف نفس --seed، ربطة إنتاج نفس التحالفات في كل مرة يتم تشغيله، ولكن ليس بالضرورة في نفس الترتيب. هذا لا HOLD عبر إصدارات مختلفة من ربطة. عدة إصلاحات الشوائب الأخرى.
ربطة لينكس برامج ذات صلة
