تقنية SVM لتقييم الببتيدات النمط البوتني الترتيب والملخص
- اسم الناشر:
- Pacific Northwest National Laboratory
- أنظمة التشغيل:
- Windows XP/2000/98
تقنية SVM لتقييم الببتيدات النمط البوتني العلامات
تقنية SVM لتقييم الببتيدات النمط البوتني وصف
يحتوي برنامج STEPP على تنفيذه لآلة SPM (دعم الدعم) المدربين يمكن أن يحسب درجة يمثل كيفية "النبسم" الببتيد عن طريق LC-MS. يمكن للبرنامج قراءة ملف البروتين، وأداء هضم في السيليكو، وحسب درجة إمكانية المراقبة لكل الببتيد المحترم أو جزئيا. لاحظ أن الدرجات الكبيرة (الإيجابية) تعني أن الببتيد من المتوقع أن يكون أكثر من البروتينات في حين أن الدرجات المنخفضة (السلبية) تعني الببتيد من المتوقع أن تكون البروتينية. يعد نموذج SVM المستخدمة من قبل STEPP مساحة واصف بسيطة بناء على 35 خصائص لمحتوى الأحماض الأمينية، وشحن، والمراعي، وقطبية القطبية للتنبؤ الكمي للببتيدات البروتينية. تم تدريب النموذج والتحقق من صحته مع قواعد بيانات AMT المستمدة بشكل مستقل (Shewanella Oneidensis، Salmonella Typhimurium، Yersinia Pestis). أسفرت SVM عن مقياس دقة متوسط قدره 0.8 من الانحراف المعياري بأقل من 0.025.
تقنية SVM لتقييم الببتيدات النمط البوتني برامج ذات صلة