باماراي تحميل مجاني ، باماراي تحميل على برنامج تحميل

BAMarray هو تطبيق المتقدمة والمهنية التي تطبق tehcnique BAM. BAM هي تقنية إحصائية جديدة للكشف عن الجينات التعبير عن تفاضلي من البيانات ميكروأري. في قلب الأسلوب هو نوع خاص من تقنية كشف إشارة إلى أن يسحق أسفل إشارة خاطئة في حين ترك إشارة حقيقية وحدها. الأساليب القياسية للبحث عن الجينات من خلال الاعتماد على إحصاءات اختبار الابتدائية باستخدام بيانات من جين واحد في وقت واحد (مثل تي الاختبارات، أو تناقضات من الموديلات ANOVA). ويتم الحصول على قوائم الجينات من خلال تصفية الإحصاءات خلال محاولة للسيطرة على خطأ النوع الأول العام، أو معدل اكتشاف كاذبة، أو من خلال تصفية باستخدام مستوى قطع المستخدم المحدد. BAM نهجا مختلفا جذريا، ويركز بدلا من ذلك على تقدير تأثير الفرق من الجين عن طريق تجميع المعلومات عبر جميع الجينات في وقت واحد. بدلا من تصفية الجينات، يتم تعيين الآثار التقديرية إلى أنواع نمط. تنكمش آلية BAM في الكشف عن إشارة خاصة إلى الصفر الآثار التقديرية للجينات المرجح أن يكون التعبير عن تفاضلي، وبالتالي أنماط مصلحة أصبح للتفسير بشدة باستخدام أدوات التصور رسومية. أنماط الفائدة قد يكون "الكر والفر" الجينات التي تؤثر على نظام بيولوجي فقط لفترة معينة من الزمن، أو الجينات المسؤولة عن جميع مراحل العملية. ينطبق BAM لmultigroup التصاميم التجريبية، مثل البيانات التي تم جمعها خلال مراحل مختلفة من المرض. وتشمل التطبيقات الأخرى الجين الوقت التعبير التنميط للبيانات الوقت طبعا، كشف المنحرف، ثابتة مجموعة التطبيع، الجينات أطلس Transcriptome على تعيينات، وكذلك العديد من ومشاكل أخرى. الخصائص الرئيسية: BAMarray هو تطبيق جافا سهل الاستعمال الذي يعمل على أنظمة تشغيل مختلفة. BAMarray كما يمكن تشغيل غير المراقب في وضع دفعي التي بدأها ملف نصي. دفعة الوضع يمكن معالجة عدة ملفات البيانات بشكل تسلسلي وحفظ التحليل الناتج إلى القرص. كتابة النصوص مصمم خصيصا تسمح للمستخدمين التفاعل مع أنواع مختلفة من البرامج، مثل Bioconductor، وR. BAMarray لديه ميزة حفظ تشغيل مما يسمح للمستخدمين لحفظ نتائج جولة لاسترجاع لاحق. والمدى الذي يمكن أن يستغرق دقيقة لتنفيذ يمكن استعادة في ثوان فقط باستخدام استعادة تشغيل. حفظ تشغيل ويمكن أيضا أن تسبب في دفعة واسطة. تصاميم التجريبية مع ويقيم مجموعة غير محدودة. تتوفر لتحديد أنواع معينة من الأنماط الجينية المؤامرات التصور. BAMarray يصنف تلقائيا الجينات إلى الأنماط الجينية. BAMarray هو تلقائي تقريبا، وخالية من المعلمات ضبط معقدة. معظم الأساليب الإحصائية تتطلب مستخدم تحديد تصفية قيمة لتحديد الجينات الهامة. يوفر BAMarray قيمة الآلي. غير متكافئ الفروق بين الجينات ويتم التعامل مع المجموعات التجريبية بشكل منتظم من قبل خطوة الآلي تجهيز قبل أن لا يثبط بشكل مصطنع أو تضخيم الاختلافات مجموعة عبر الجينات (كما رأينا مع التحولات الأخرى، مثل اللوغاريتمات). الأدوات الرسومية باستخدام التكبير في وlassoing تسمح للمستخدمين لتوليد تفاعلي قوائم الجينات. تسميات جين يمكن أن يكون مثبت أو إيقاف تشغيله السماح الجينات التي تهم تحديدها بسهولة. يمكن إبراز جينات محددة باستخدام القائمة المنسدلة أو عن طريق ملء قائمة تتبع من العلامات الجينية الموجودة في ملف موجود. قوائم الجينات يمكن تصديرها. قوائم التصدير يمكن أن يكون آليا باستخدام دفعة واسطة. يمكن حفظ الأرقام والرسومات الجودة نشر اللون. تدرج مؤامرات لاختبار الافتراضات الأساسية للنموذج كجزء من مجموعة الرسومات. يدعم JRE 6.

باماراي برامج ذات صلة