أساتورا إظهار التشبع في تسلسل النوكليوتيد
التحميل الان

أساتورا الترتيب والملخص

أساتورا العلامات

تسلسل تأثير التشبع تشبع صمام التشبع التشبع المشكل خوارزمية التشبع تشبع الشريط محاكاة التشبع التشبع الأسود التشبع الضابط ضبط التشبع تغيير التشبع إصلاح التشبع تغيير التشبع الشرطي تشبع فوتوشوب مولد كوكب 3D نسبة النيوكليوتيد طفره تتبع التشبع تسلسل النوكليوتيد مدير تسلسل النوكليوتيد النيوكليوتيد التشبع المحول محاكاة التشبع التناظرية التشبع تعديل التشبع تعديل التشبع التشبع الصحيح استبدال النيوكليوتيد نموذج عزر النوكليوتيد يتظاهر استبدال النيوكليوتيد شرح النوكليوتيد محاذاة النوكليوتيد تعدد الأشكال النوكليوتيد طفرة النيوكليوتيد جزء النوكليوتيدات جزر باسيفيك شاشة التوقف جافا مكافحة الفيروسات ملف الترميز FLV. فرنك سويسري لرابطة العمل المنصف كيف تقرأ تورنت لايت خربش القفز 1.8.2. ياهو فيديو روكسكسانا - بلاك بيري 1800 البرمجيات كاريوكي أغنية CDG.

أساتورا وصف

إن الطريقة المعتادة لإظهار التشبع في تسلسل النوكليوتيد هي رسم جزء من الاختلافات بين التسلسلات ضد المسافة التطورية التي تفصلها. عندما يكون عدد الاختلافات التي تمت ملاحظتها، على سبيل المثال جزء من مواقع Codon الثالثة، لم تعد تزداد مع زيادة المسافة التطورية، يقال إن التسلسل مشبع. يمكن تطبيق نفس التقنية على تسلسل الأحماض الأمينية (AA). لقد قمنا بتطوير تطبيق Java يسمى Asatura يميز بدائل AA مع احتمالات عالية ومنخفضة للحدوث. يتم تعريف جميع بدائل AA إما ك "متكررة" أو "نادرة" اعتمادا على احتمالات طفرةها، والتي يتم استنتاجها من مصفوفات احتمالية الاستبدال، مثل PAM المعروفة و Blosum. توفر هذه المصفوفات العشرين من 2020 حالة الاحتمالات المشتقة التجريبية من AA التي يتم استبدالها من قبل واحدة أخرى عندما تباعدت التسلسلات على مسافة تطورية معينة. سيقوم تطبيق Asatura بفرز جميع بدائل وفقا لهذه الاحتمالات ويمكن اختيار قيمة "قطع" الاحتمالية التي تتلاءم بين البدائل المتكررة والنادرة. لكل زوج تسلسل، فإن البرنامج يتأرجح عدد بدائل AA المتكررة وغير النادرة المرصودة ضد مسافةها التطورية. من خلال تعديل القيمة "قطع" الاحتمالية "، يمكن تغيير عدد بدائل AA المصنفة على أنها متكررة أو نادرة. من الناحية المثالية، فإن الاختيار الدقيق للقيمة "القطع" تقسم البيانات الأصلية المحددة في واحدة مشبعة وغير مشبعة. إلى جانب مزادات الاحتمالات الاستبدال الأكثر استخداما على نطاق واسع، مثل PAM و Blosum و MTREV24 و JTT، يمكن استخدام مصفوفات المعرفة من قبل المستخدم أيضا.

أساتورا برامج ذات صلة