| | varscan. |
| التحميل الان | |
varscan. الترتيب والملخص
الإعلانات
- رخصة:
- Freeware
- السعر:
- FREE
- اسم الناشر:
- Daniel C Koboldt
- موقع ويب الناشر:
- http://www.massgenomics.org/about
- أنظمة التشغيل:
- Mac OS X
- حجم الملف:
- 59 KB
varscan. العلامات
varscan. وصف
كشف البديل في بيانات التسلسل الموازية بشكل كبير Varscan عبارة عن أداة مجانية ومفتوحة ومفتوحة، أداة برمجية مستقلة من النظام الأساسي لتحديد SNPs والصفقات في تسلسل متوازي على نطاق واسع للعينات الفردية والمجموعة. تعطى البيانات المعطاة لعينة واحدة، يحدد Varscan وترشيح المتغيرات الخميرة بناء على عدد مرات القراءة والجودة الأساسية وتردد الألياف. نظرا لبيانات الزوج العادي الورم، تحدد Varscan أيضا الحالة الجسدية لكل متغير (Germline أو الجسدية أو اللوح) من خلال مقارنة عدد مرات القراءة بين العينات. فيما يلي بعض الملامح الرئيسية "Varscan": يدعو SNPs وإحصاءات من ملفات Samtools Pileup فلاتر المتغيرات عن طريق التغطية، وقراءة العمق، والتردد البديل، ونوعية الأساس يحدد الوضع الجسدي (جسدي، غرس، لوه) أزواج ورم طبيعية يقارن، يدمج، وتتقاطع قائمتين من المتغيرات يحد من المكالمات المتغيرة إلى مجموعة من المناصب المستهدفة أو المناطق المستهدفة مجانا للاستخدام غير التجاري. متطلبات: جاوة
varscan. برامج ذات صلة