| | prottest. |
| التحميل الان | |
prottest. الترتيب والملخص
الإعلانات
- رخصة:
- Freeware
- السعر:
- FREE
- اسم الناشر:
- PROTTEST Team
- موقع ويب الناشر:
- http://darwin.uvigo.es
- أنظمة التشغيل:
- Mac OS X
- حجم الملف:
- 4.1 MB
prottest. العلامات
prottest. وصف
برنامج لتحديد نموذج تطور البروتين الذي يناسب مجموعة تسلسل PROTTEST هو برنامج مجاني ومفتوح المصدر لاختيار نموذج تطور البروتين الذي يناسب مجموعة معينة من التسلسلات (المحاذاة). يستعد على برنامج PHYML (للحصول على حسابات الاحتمالات القصوى وتحسين المعلمات) ويستخدم مكتبة PAL كما نحن سوف. النماذج المدرجة هي مصفوفات استبدال تجريبية (مثل Wag، LG، MTREV، DIAHOFF، DCMUT، JTT، VT، BLOSUM62، CPREV، RTREV، MTMAM، MTART، HIVB، و HIVW) تشير إلى معدلات استبدال الأحماض الأمينية، وتحسينات محددة لحساب القيود التطورية المستحقة من خلال الحفاظ على هيكل البروتين ووظيفة. يستخدم Prottest معيار معلومات Akaike (AIC) وإحصائيات أخرى (AICC و BIC) للعثور على أي من النماذج المرشحة تناسب البيانات بشكل أفضل. متطلبات: جاوة
prottest. برامج ذات صلة
