Pyrx عرض البيانات الجزيئية مع هذه الأداة
التحميل الان

Pyrx الترتيب والملخص

Pyrx العلامات

تحليل محلل - مشاهد الجزيء محلل الهدف المخدرات عملية اكتشاف المخدرات

Pyrx وصف

عرض البيانات الجزيئية مع هذه الأداة Pyrx هو تطبيق عرض افتراضي سهل الاستخدام مصمم خصيصا لاستكشاف المخدرات الحاسوبية التي يمكن استخدامها لشهر مكتبات المركبات مقابل أهداف المخدرات المحتملة. يمكن Pyrx الكيميائيين الطبيين لتشغيل الفحص الافتراضي تشكل أي نظام أساسي ويساعد المستخدمين في كل خطوة على هذه العملية - من إعداد البيانات إلى تقديم الوظائف وتحليل النتائج. على الرغم من أنه صحيح أنه لا يوجد زر سحري في عملية اكتشاف المخدرات، يتضمن Pyrx معالج الإرساء مع واجهة مستخدم سهلة الاستخدام مما يجعلها أداة قيمة لتصميم المخدرات بمساعدة الكمبيوتر. تشمل Pyrx أيضا وظيفة تشبه جدول البيانات الكيميائية ومحرك التصور القوي الضروري لتصميم المخدرات الرشيد. ما الجديد في هذا الإصدار: وأضاف حفظ كأداة قيم مفصولة بفواصل (CSV) لجداول قاعدة البيانات. وأضاف ميزة التآمر جداول قاعدة البيانات. يمكن الوصول إلى هذه الميزة من خلال زر شريط الأدوات ضمن علامة التبويب الجداول. بشكل افتراضي، يفتح مربع حوار تخطيط الجدول حيث يتم عرض مؤامرة شريط طاقة ملزمة مقابل LIGAND (فهرس). إذا كانت لديك Pubchem Bioassay مفتوحة باستخدام زر مفتوح CVS، فسيحقق هذه القطعة أيضا لمعرفة ما إذا كان هناك عمود النتائج في هذا الجدول، وإذا كان الأمر كذلك، فسوف يتوافق على أشرطة اللون "النشطة" المركب الأحمر والأشرطة المقابلة "غير نشط" وبعد تغيير حقل القوة الافتراضي لفتح تقليل طاقة Babel من UFF إلى MMFF94. غير المتغيرة الافتراضي للحصول على أقصى عدد من تقييمات الطاقة (المعلمة الخوارزمية العامة في Autodock) من الوسط (GA_NUM_EVALS = 2500000) إلى قصيرة (GA_NUM_EVALS = 250000). وأضاف Autodock PBS إرسال وظيفة جدور الحوار. تم إصلاح الخلل الذي كان يسبب مشاكل عند عرض الأسطح الجزيئية لمتوافق الرصاص. وأضاف مربع حوار لتحديد التشكل البديل عند إجراء ملف Macromollecule (PDBQT) ل Autodock. تمكين وكيل جودة المعالم التي يمكن استخدامها للحصول على تقرير علة وتعليقات من المستخدم. وأضاف إلغاء الخيار لخدمات الويب Autogrid. نفذت بقايا مرنة ل Autodock. يمكن الوصول إلى هذه الميزة عن طريق تحديد البقايا (البقايا) ضمن جزيئات Navigator-> النقر بزر الماوس الأيمن عليها. حدد Autodock -> بقايا مرنة لإنشاء مجلد _Flex ضمن Navigator -> Autodock -> MacromoLecules مع مستقبلات PDBQT و Flex.PDBQT. يتم بعد ذلك إجراء جميع الإرساء إلى هذه المستقبلات مع هذه البقايا المرنة. تحديث Python إلى الإصدار 2.6 و ETS إلى 3.4.0.

Pyrx برامج ذات صلة