نظام وظيفة مكرمة تصور الجينومات الكبيرة بسهولة
التحميل الان

نظام وظيفة مكرمة الترتيب والملخص

نظام وظيفة مكرمة العلامات

رأي متخيل جينوم عرض جينوم عارض الجينوم متخيل الجينوم

نظام وظيفة مكرمة وصف

بسهولة تصور الجينوم الكبيرة نظام التشغيل المكرر هو أداة مجانية وسهلة الاستخدام لتصور الجينوم الكبيرة من قبل تمثيل لعبة Chaos CGR (Jeffrey 1990). CGR يحول تسلسل الحمض النووي إلى الصورة الملونة (الشكل على اليمين). كل بكسل يتوافق مع سلسلة قصيرة من رموز N تسمى N-MER. يعكس لون بكسل تردد N-Mer في التسلسل الذي تم تحليله. المعلمة الرئيسية للتصور، أي المنطقة في الجينوم المستخدمة في التصور يتم التحكم فيها بواسطة شريط التمرير في الجزء العلوي من النافذة. يمكن للمستخدم تحديد المنطقة مباشرة عن طريق إدخال موضع بدء الطول، أو استخدام عنصر تحكم منزلق لنقل المنطقة بسرعة من خلال الجينوم. يتم عرض الموضع الفعلي وطول المنطقة في التحكم في شريط التمرير كشريط أحمر مع حجم الحجم المقابل. قد يتضمن بتنسيق "Genebank" مواصفات الميزات الجينية مثل الجينات، مرنا، إلخ. يتم استخراجها من ملف الإدخال ومدرجة في جزء الميزات من النافذة. بعد تحديد المستخدم ميزة يتم عرض وصفه في الجزء الأيمن. يمكن استخدام زر التصور لتصور الميزة المحددة على الفور. هذا يسمح لنا بسهولة بتحليل الأجزاء المهمة من جينوم ببساطة بنقرة واحدة. يتم سرد معلمات التصور واحدة في إعدادات التصور القسم. نطاق اللون، أي تحويل تردد Oligomer إلى لون HeatMap يمكن ضبطه. يتم عرض الحد الأدنى للقيمة باللون الأزرق والحد الأقصى باللون الأحمر. عند اختيار التعديل التلقائي لمجموعة الألوان، يتم إعادة حساب القيمة القصوى دائما لعرض أولغومر أكثر تكرارا باللون الأحمر. يمكن تحقيق تسليط الضوء على OLIGOMERS بتردد منخفض وعالي في وقت واحد بواسطة مقياس لوغاريتمي ل Heatmap Color Heatmap، I.E. يتم تطبيق سجل (Count) على القيمة المضادة.

نظام وظيفة مكرمة برامج ذات صلة