موليكل تحميل مجاني ، موليكل تحميل على برنامج تحميل

تطبيق التصور الجزيئي المجاني والمفتوح ل Mac الخاص بك Molekel هو مصدر مفتوح وسهل الاستخدام وبرنامج التصور الجزيئي متعدد المنصات. فيما يلي بعض الملامح الرئيسية "Molekel": قراءة البيانات الجزيئية من تنسيقات ملفات مختلفة عرض الجزيئات ذات الأساليب المختلفة: Spacefill، الكرة والعصا، الكرة والأسلاك، عصا، العمود الفقري (بقايا)، الشريط (بقايا)، تخطيطي (بقايا) تغيير الذرة وحجم السندات قراءة ألوان الذرة من الملف عرض لحظة ثنائي القطب (للتنسيقات الجزيئية التي تحتوي على هذه المعلومات) تحريك الذرات باستخدام معلومات المسار والاهتزاز المتوفرة في بعض تنسيقات الملفات تحريك جزيئات القراءة من ملفات PDB و XYZ متعددة الإطار عرض الأسهم لإظهار سرعة واتجاه حركة كل ذرة الرسوم المتحركة تحريك الأسطح الجزيئية (أثناء تصدير التعب) إجراء المسافة وحسابات زاوية (Dihedral) استخدم مسبار مخطط لتصور حقول العددية (E.G. الإمكانات الكهربائية) وعرض قيمة حقل العددية في نقطة محددة في الفضاء ثلاثي الأبعاد. تصور الأسطح ISO المدارية الجزيئية اختياريا تلوين اللون مع إمكانات كهرباء. تصور الأسطح الناتجة من مصفوفة كثافة اللون اختياريا مشفرة مع إمكانات كهرباء. تصور الأسطح من بيانات الشبكة (بتنسيق مكعب Gaussian أو قراءة من ملفات Tape41 ADF) اختياريا مشفرة بالألوان بإمكانات كهرباء. الأسطح الملساء الناتجة عن بيانات الشبكة (Gaussian .Cube) مع تجانس Laplacian استخدم بيانات الشبكة قراءة من ملفات .Cube كإحكانية كهرباء جزيئية للخريطة على SAS و SES STFACES حساب السطح قابل للوصول إلى المذيبات كأسرة ISO - ترميز اللون اختياريا مع إمكانات كهرباء. حساب وعرض السطح المستبعدة المذيبات، اختياريا باستخدام M.F. برنامج Sanner's MSMS (يوصى بشدة)، واحصل عليه هنا جزيء التصدير لعدد من تنسيقات الملفات الجزيئية تصدير إلى بوف (تجريبية، من خلال OpenBabel) تصدير إلى TIFF، PNG، بوستسكريبت و PDF دعم التظليل القابل للبرمجة (GLSL) تصور أطياف الإشعاع (الأشعة تحت الحمراء ورامان) عرض متعدد النقاط عالية الجودة مع مكافحة التعرج والعرض الصحيح للأسطح الشفافة متعددة الطبقات مزج أوضاع اهتزازية ما الجديد في هذا الإصدار: وأضاف دعم تقشير العمق للتوجيه الصحيح للكائنات الشفافة؛ يتطلب بطاقة OpenGL 2.0 وقد لا يعمل بشكل صحيح على بعض الأنظمة. يمكن ضبط معلمات تقشير العمق التي تؤثر على سرعة التقديم / جودة الكائنات الشفافة من خلال شاشة عرض خصائص العرض. وأضاف مؤامرة الأطياف الأشعة تحت الحمراء ورامان مع إخراج بوستسكريبت و PDF متكامل مع VTK 5.1 (إصدار CVS لأنه لا يوجد إصدار رسمي بعد) إضافة دعم لمكافحة التعرجات، المعوقين بشكل افتراضي؛ يمكن تمكينها من خلال عرض مربع الحوار "عرض الخصائص". من الممكن الآن تغيير الشفافية والألوان من الأسطح المدارية. وأضاف دعم الإعدادات المستمرة في مربع حوار سطح كثافة الإلكترون. وأضاف تظليل الأشعة السينية الجديدة التي تعمل بشكل صحيح مع VTK 5.1. إصلاح الأخطاء: 392 - إضافة دعم لإدخال Gamess متعدد الجزيئات 401 - لا يمكن حذف سطح كونولي 403 - دعم سطر الأوامر 404 - خطأ في قراءة البيانات المدارية الجزيئية مولد 405 - الشفافية لا تتفق مع كل من الألوان المدارية (تعتمد على بطاقة / سائق محددة) 406 - يعمل الرسوم المتحركة بعد حذف الجزيء 408 - طلب ميزة: بدء مؤشر المداري من الصفر 420 - الإعدادات غير محفوظة عند إغلاق النافذة 421 - سطح من بيانات الشبكة: الوقت المنقضي تقرير خطأ 422 - لا يمكن حفظ الرسوم المتحركة مع SES شفافة

موليكل برامج ذات صلة