مخطط RFLP. مخطط RFLP - العثور على إنزيمات تقييد تساعد في تختلف تسلسل الحمض النووي المعروف
التحميل الان

مخطط RFLP. الترتيب والملخص

مخطط RFLP. العلامات

تجد محاكاة طفره العثور على طفرة محاكاة الكهربائي العثور على تقييد enzime.

مخطط RFLP. وصف

مخطط RFLP - العثور على انزيمات التقييد التي تساعد في تختلف تسلسل الحمض النووي المعروف RFLP Planner هو تطبيق مفتوح المصدر الذي سيساعدك في تخطيط تجربة RFLP: فهو يجد إنزيمات تقييد تقطع مجموعة من تسلسل الحمض النووي المتماثل بطرق مختلفة وتحاكي صورة هلام الناتجة الناتجة. يجب أن يكون مخطط RFLP منصة مستقلة، ولكن تم اختباره فقط على Mac OS X. يساعدك على العثور على إنزيمات التقييد الحاسمة التي تميز السكان. مع محاكاة الكهربائي، من السهل اختيار انزيمات التقييد التي تظهر أفضل تعدد الأشكال على الجل. الكلمة الرئيسية المهمة هي التنوع البيولوجي. يتم كتابة البرنامج في بيرل، ويستخدم بعض الوحدات النمطية من BIOPERL ومكتبة GD. يجب أن يكون مخطط RFLP مستقل منصة، ولكن يتم اختباره فقط على Mac OS X.Here بعض الميزات الرئيسية ل "مخطط RFLP": محاكاة Gelimages (PNG): كل تسلسل صورة واحدة. كل صورة مع علامة الوزن الجزيئي. كل تقييد إنزيم فتحة واحدة. يتم إجراء تقييم مع قاعدة بيانات إنزيم تقييد Bioperl بالكامل، ولكن يمكن إضافة الإنزيمات المرغوبة أيضا (موقع إنزيما أو تقييد ^) لا يتم استخدام isoshizomers لحسابات (ولكن تظهر في الأجزاء الناتجة. يمكن تقسيم التسلسلات إلى نفس الطول أم لا، ولكن بالنسبة إلى gelimage تستخدم التسلسلات الأصلية يمكن استخدام عصابات علامات الوزن الجزيئية المرغوبة خيار تسمية الصور (مع اسم التسلسل) الكثير من تنسيقات مختلفة في الإخراج مدعومة (Bioperl) إساءة استخدام البرنامج لقطع تسلسل التمهيدي من مجموعة من التسلسلات: 1. في تسلسل واحد تخفيض التسلسل التمهيدي يدويا 2. استيراد جميع التسلسلات (FASTA) 3. اختر: tramm = 1، aligned_format = 'fasta' إزالة تلقائية تسلسل محاذاة سيئة اختيار مجموعة من إنزيمات تقييد البحث (4، 6، .. القاطع) تسلسل التكميل العكسي التلقائي (لا يعمل بكمية كبيرة من SEQ؛ إذا لم ينجح محاولة مع أقل تسلسلات، محاذاة EXOPR في FASTA ، الانضمام إلى ليرة لبنانية تسلسل مرة أخرى، احسب الكل)

مخطط RFLP. برامج ذات صلة