عجوان مشروع شامل مقره بجافا يدرس خصائص الحمض النووي وتسلسل البروتين
التحميل الان

عجوان الترتيب والملخص

عجوان العلامات

بروتين دراسة الحمض النووي تسلسل البروتين دراسة الحمض النووي عرض الحمض النووي

عجوان وصف

مشروع شامل مقره جافا يدرس خصائص الحمض النووي وتسلسل البروتين تعد Magpie أو بيئة التحقيق الآلي للأغراض متعددة الأغراض حزمة برامج لعرض تلقائي لتسلل الحمض النووي والبروتين. يتم عرض معلومات Magpie حول احتمال ترميز شركة ORF كمجموعة من 6 سمات. يتم توفير هذه المعلومات في رسومات Contig وفي خط معلومات OF على الصفحة الخضراء. تعكس Fual Thoributes Threibutes أول ثلاث خصائص قابلة للحساب للتسلسل، في حين يصف PDM مقدار الأدلة الخارجية (من خلال عمليات البحث عن قاعدة البيانات) لدينا حول وظيفة التسلسل. كلما زاد الأزرق (المستوى 1) في المربع، زاد الأرجح أن ORF هو حقا تسلسل ترميز. (F): (نعم / لا) هل تسلسل الترميز المحتمل تناسب ملف تعريف استخدام كودون الكائن الحي (باستخدام ثقة 99 من الخير CHI-Square من اختبار FIT) A: (نعم / لا) هو A + G من التسلسل > 50، خاصية تسلسل الترميز في العديد من الكائنات الحية C: (المستوى 1 أو 2 أو 3 أو 4) ما هو مستوى تعويض G + C في مواقع الرموز الثانية والثالثة؟ سيتبع معظم الكائنات الحية نمطا على محتوى G + C أعلى في موقف "Waggle" الثالث. P: (المستوى 1،2 أو 3) يشير إلى أفضل مستوى من الأدلة التي لدينا والتي تتكون من مباراة على مستوى البروتين (على سبيل المثال ضد Genpept، أو Mrna / CDNA على مستوى البروتين. D: (المستوى 1، 2 أو 3) يشير إلى أفضل مستوى من الأدلة التي يتكون من أننا يتكون من تطابق تسلسل الحمض النووي في مستوى النقش الحمض النووي (مثل البحث عن جنرال) M: (المستوى 1 أو 2 أو 3) يشير إلى أفضل مستوى من الأدلة التي يتكون من ذلك من المباريات إلى أسر البروتين (مثل PFAM) أو متطلبات موقع الويب الربط المعروفة (Prostite): جاوة

عجوان برامج ذات صلة