 | جالفيومحرر محاذاة متعدد مجاني مكتوب في جافا |
| التحميل الان | |
جالفيو الترتيب والملخص
الإعلانات
- رخصة:
- Freeware
- السعر:
- FREE
- اسم الناشر:
- The Barton Group
- موقع ويب الناشر:
- http://www.jalview.org/
- أنظمة التشغيل:
- Mac OS X
- حجم الملف:
- 1 KB
جالفيو العلامات
جالفيو وصف
محرر محاذاة مجاني مجاني مكتوب في جافا JalView هي أداة مفتوحة المصدر تستخدم على نطاق واسع في مجموعة متنوعة من صفحات الويب (على سبيل المثال، خادم Ebi Clustalw وقاعدة بيانات مجال بروتين PFAM) ولكنه متاح كمحرر محاذاة للأغراض العامة. فيما يلي بعض الملامح الرئيسية ل "Jalview": واجهة المستخدم: ترتبط الضوء على الكودون والحمض الأميني من منتجات الترجمة والبروتين تسليط الضوء على الهيكل المرتبط بمقايضة رسم خرائط للمبايا تسلسل Fetcher يوفر مثال أرقام الانضمام و "واضح" مئوية موضحة مضافة كخيار ضمن قائمة أدوات سطح المكتب استخراج وظيفة وظيفة لتحليل Whitespace البيانات الرقمية مفصولة في خط الوصف يمكن أن تتركز ملصقات العمود في التعليق التوضيحي المحاذاة. تلميح Tooltip للتسلسل التعليق التوضيحي خدمات الويب و URL جلب: خدمة الويب JPRED3 عميل البحث التسلسل النموذجي (لا توجد خدمات عامة متاحة بعد) جلب إما محاذاة البذور أو محاذاة كاملة من PFAM روابط URL التي تم إنشاؤها لمطابقة المراجع عبر قاعدة البيانات بالإضافة إلى معرف التسلسل يمكن إنشاء روابط URL باستخدام التعبيرات العادية اتصال قاعدة بيانات التسلسل: استرجاع التسلسلات المرجوعة من قواعد البيانات الأخرى استعادة مرجع قاعدة البيانات المعممة والتحقق من الصحة لجميع قواعد البيانات المنفذة جلب تسلسلات من مصادر DAS التي تدعم الأمر التسلسل استيراد وتصدير صفوف التصدير الصادرات ك CSV لاستيراد جدول البيانات مشاريع Jalview سجل جمعيات بيانات المحاذاة، منتجات EMBL، وتعيينات تسلسل CDNA لون مجموعة التسلسل يمكن تحديده في ملف التوضيحية تلوين المخصص للمجموعة في ملف التعليق التوضيحي باستخدام RGB ثلاثية كاسم Colourscheme قدرات عميل VAMSAS (تجريبية) Treeenode ملزمة لتبادل شجرة Vamsas التحرير المحلي وتحديث التسلسلات في محاذاة VAMSAS (تجريبية) إنشاء جلسة جديدة أو حددها للانضمام تحميل وحفظ مستندات VAMSAS سطر الأوامر التطبيق: معلمة شجرة لفتح الأشجار (تم تقديمها للانتقال من التطبيق الصغير) حجة سطر الأوامر Fetchfrom لتحديد الأسماء المستعارة لخوادم DAS للاستعلام عن ميزات المحاذاة حجة سطر الأوامر Dasserver لإضافة خوادم جديدة يتم تسهيلها تلقائيا أيضا للميزات تنفذ وسيطة سطر الأوامر Groovy برنامج نصي إيجابي معين بعد تحميل جميع بيانات الإدخال وتحليلها تبادل بيانات التطبيق الصغير: مرت الأشجار التي تم تمريرها كمعلمات التطبيق الصغير إلى التطبيق (عند استخدام "عرض في التطبيق الكامل") معلمات التطبيق الصغير: ميزة عرض معلمة التحكم في عرض المجموعة تصحيح المعلمة المعلمة Showbutton. أساليب التطبيق التطبيق API: NewView طريقة عامة نافذة (العرض الحالي) محددة الحصول على / تعيين الأساليب العامة ميزة طرق التحكم في العرض الحصول على قائمة بالتسلسلات المحددة حاليا ميزات توزيع JALView الجديدة: تثبيت InstallanWhere Installer إلى IA 2008 VP1 يقدم ملف الإصدار خصائص بناء أحدث إصدار Jalview. جافا 1.1 المباني الصغير أسهل و DonotobFusCate تحديد العقار تنفيذ Obfuscator بناء الهدف لتوليد توزيع المصادر تصحيح العلم ل Javacc . .jalview_properties ملف موثق (قليلا) في jalview.bin.cache تكامل البناء المستمر للحصول على نسخة مستقرة وتطوير التطبيقات، متطلبات: جاوة
جالفيو برامج ذات صلة
