slidemap. وحدة بيرل لإنشاء خرائط شريحة MicroArray
التحميل الان

slidemap. الترتيب والملخص

slidemap. العلامات

الوحدة النمطية بيرل بيرل الانزلاق خرائط الشريحة ميكروأري

slidemap. وصف

وحدة بيرل لإنشاء خرائط شريحة MicroArray Slidemap هي وحدة بيرل لإنشاء MicroArray Slide Maps.synopsis استخدم Slidemap؛ $ sm = slidemap-> جديد (الجهاز => "المتري"، x_pin => 2، y_pin => 6، xspacing => 0، yspacing => 0، x_repeat => 1، y_repeat => 1)؛ $ sm-> تهيئة؛ $ sm-> fill_map؛ $ map_ref = $ sm-> getmap؛ ($ Array_Row، $ array_col، $ meta_row، $ meta_col، $ sub_row، $ sub_col) = $ sm-> convert_well ($ plate_num، $ بشكل جيد)؛ ($ plate_num، $ جيدا، $ plate_row، $ plate_col) = $ sm-> convert_spot ($ array_row، $ array_col)؛ ($ _meta_row، $ _ meta_col، $ _ sub_row، $ _ sub_col) = $ sm-> get_meta ($ array_row، $ array_col)؛ $ sm-> setmachine ("المتري")؛ $ المواضيع = $ sm-> getmachine؛ $ sm-> setprinthead (2، 6)؛ ($ x_pin، $ y_pin) = $ sm-> getprinthead؛ $ sm-> setblockdimensions (25، 24)؛ ($ x_spacing، $ y_spacing) = $ sm-> getblockdimensions؛ $ sm-> setnocument ()؛ $ noccoment = $ sm-> getnoccoment؛ $ sm-> setrepeats (، )؛ ($ x_repeat، $ y_repeat) = $ sm-> getrepeatmode؛ $ sm-> setrepeatmode ()؛ $ treatmode = $ sm-> getrepeatmode؛ $ sm-> setformat ()؛ $ plate_format = $ sm-> getformat؛ $ sm-> setprintdirection ()؛ $ الاتجاه = $ sm-> getprintdirection؛ $ sm-> setplateorder ("")؛ $ plate_order = $ sm-> getpluater؛ ($ max_array_row، $ max_array_col) = $ sm-> getarraydimensions؛ ($ x_pitch، $ y_pitch) = $ sm-> getpitch؛ $ number_of_spots = $ sm-> getnumspots؛ $ sm-> التشخيص؛ $ sm-> print_spots ()؛ $ sm-> print_wells ()؛ $ sm-> showconvertwell؛ $ sm-> showconvertspot؛ يتم استخدام slidemap لإنشاء صف / كول -> لوحة / خريطة جيدة لشريحة microarray. لا يدمج بعد إدراج بيانات التوضيح في الخريطة، ولكن ببساطة يقوم بإنشاء كائن الخريطة بناء على معلمات الإدخال. الخريطة هي قائمة أمرت بالبقع مع مراجع إلى صفائف إلهوية تحتوي على Array_Row، Array_Col، Plate_alias، حسنا. يدعم Slidemap حاليا 5 أنواع من المضبوطات: IAS (الافتراضي)، MD، MD3، لوكيديا، و Stanford. (سيتم تنفيذ آخرين حسب الحاجة.) يوفر Slidemap طريقتين لتحويل البقع-> الآبار والملزمة العكس، بناء على المعلمات المثبطة. المعلمات الرئيسية هي: الجهاز: نوع آلة طباعة الصفيف المستخدمة (IAS هي الافتراضي) X_PIN: عدد أقلام رأس الطباعة في البعد "X" (plate_row) y_pin: عدد أقلام رأس الطباعة في البعد "y" (plate_col) (x_pin = 2، و y_pin = 6 هي الإعدادات الافتراضية) x_spacing: عدد المواقع في صف واحد من كتلة على صفيف Y_Spacing: عدد المواقع في عمود واحد من كتلة على الصفيف (x_spacing = 24، و y_spacing = 25 هي الإعدادات الافتراضية) x_repeat: عدد الكتلة المتكررة في " X 'البعد (افتراضي = 1) y_repeat: عدد الكتلة المتكررة في متطلبات "Y" (الافتراضي = 1): perl.

slidemap. برامج ذات صلة