estscan. اكتشاف مناطق الترميز في تسلسل الحمض النووي، حتى لو كانت ذات جودة منخفضة
التحميل الان

estscan. الترتيب والملخص

estscan. العلامات

يكشف ترميز تسلسل الحمض النووي كشف مناطق الترميز أخطاء التسلسل الصحيحة estscan.

estscan. وصف

اكتشاف مناطق الترميز في تسلسل الحمض النووي، حتى لو كانت ذات جودة منخفضة مشروع ESTSCAN هو برنامج يمكنه اكتشاف مناطق الترميز في تسلسل الحمض النووي، حتى لو كانت ذات جودة منخفضة. سيكتشف ESTSCAN أيضا وتصحيح أخطاء التسلسل التي تؤدي إلى FRAMESHIFTS.ESTSCAN ليس برنامج التنبؤ الجيني، ولا هو كاشف مفتوح لإطار القراءة. في الواقع، تكمن قوته في حقيقة أنه لا يتطلب إطار قراءة مفتوح للكشف عن منطقة ترميز. نتيجة لذلك، قد يفوت البرنامج عدد قليل من الأحماض الأمينية المترجمة في الطرف الأيمن أو C، ولكن سيكتشف مناطق الترميز ذات الانتقائية والحساسية العالية. يأخذ MethodestScan مزايا التحيز في استخدام Hexanucleotide الموجود في مناطق الترميز بالنسبة لغير مناطق الترميز. يتم إضفاء الطابع الرسمي على هذا التحيز باعتباره نموذج ماركوف خامس من الدرجة الخامسة غير المتجانس لمدة 3 دراسية (HMM). بالإضافة إلى ذلك، تم تمديد HMM من ESTSCAN لاستيفاء الإدراج والحذف عند تحسين إحصاءات منطقة الترميز. ما الجديد في هذا الإصدار: أضف بعض الشيكات المعنية في برنامج Makesmat، بحيث لا تعطل على إدخال غير صحيح ويوفر رسائل خطأ مفيدة محتملة

estscan. برامج ذات صلة