dawgpaws. مجموعة من برامج سطر الأوامر مكتوبة في بيرل التي تسرع في التعليق التوضيحي للجينات وعناصر التعريف في الجينوم النباتية
التحميل الان

dawgpaws. الترتيب والملخص

dawgpaws. العلامات

حاشية. ملاحظة جين التوضيحي الجينات عناصر التعريف نبات النبات التعويذة

dawgpaws. وصف

وثمة مجموعة من البرامج سطر الأوامر مكتوبة في بيرل الذي يسرع الشرح الجينات وجين قافز في الجينوم المصنع وقد صممت هذه البرامج النصية في جناح DAWGPAWS لتسهيل الجيل إنتاجية عالية من النتائج الحسابية لكلا geneDAWGPAWS هو مجموعة من النصوص المكتوبة في بيرل التي ديسينجيد لمساعدة الفريق العامل الشرح الموزعة (دوغ) في تسلسل الشرح من BAC الحجم contigs. منذ هذه مجموعة من البرامج وكتب في البداية لتعليم عينة عشوائية البكالوريا القمح، ويشار إليها باسم خط أنابيب لAnnoate Sequnces القمح (آثار أقدام). على الرغم من أن هذه البرامج صممت في البداية لزراعة القمح، ويمكن تطبيق البرامج النصية إلى ما يقرب من أي مخطوطات pipeline.The تسلسل annoation حقيقية النواة في جناح DAWGPAWS تم تصميمها لتسهيل الجيل إنتاجية عالية من النتائج الحسابية لكل من الشرح الجينات والشرح جين قافز باستخدام عدد من برامج التعليق التوضيحي تسلسل القائمة. يتم تحويل هذه النتائج من إخراج الأصلي من برامج الشرح الفردية إلى تنسيق ملف مهرجان الخليج السينمائي القياسية. منذ ملف مهرجان الخليج السينمائي هو علامة تبويب بسيطة ملف نصي delmited، والنتائج الحسابية متعددة لتسلسل واحد يمكن بسهولة أن تكون متصلا معا باستخدام أدوات maninpulation النص القياسية مثل القط. دليل على أن القطط ودوغس] يمكن أن تلعب معا بشكل جيد. يوفر DAWGPAWS أدوات إضافية لتسهيل استخدام أداة التنظيم أبولو الجينوم الشرح لرؤية وكرأيشن من results.Usage الحسابي لDAWGPAWS البرنامج هو عبارة عن سلسلة من البرامج سطر الأوامر. وقد تم اختيار واجهة سطر الأوامر منذ وعادة ما يتم تشغيل هذه البرامج عن بعد على أجهزة preformance عالية تشغيل بعض إصدارات نظام التشغيل يونيكس / لينكس. منذ و inteface سطر الأوامر لقد كتب لجميع البرامج، لا يلزم معرفة خاصة بيرل لاستخدام هذا الجناح. ومع ذلك، لأن بعض البرامج النصية Perl تعتمد على وحدات بيرل الخارجية، وعلى معرفة العمل من بيرل تكون مفيدة عند تثبيت DAWGPAWS.How إلى سايت تم تقديم DAWGPAWSA مخطوطة واصفا البرنامج DAWGPAWS. حتى يتم نشر هذه المخطوطة، يرجى الرجوع إلى الموقع DAWGPAWS سورس عندما تصف استخدامك لهذا program.JC Estill وJL Bennetzen. 2009. DAWGPAWS خط أنابيب لشرح من الجينات وجين قافز في خريطة جينوم النباتات. الشرح ProgramsDAWGPAWS تضم مخطوطات للعمل مع الأدلة الحسابية من البرامج مستقل التالية والمواقع على شبكة الإنترنت. يمكنك الحصول على معلومات عن البرامج التالية من خلال النقر على اسم البرنامج الشرح، ويمكنك الحصول على وثائق النصي DAWGPAWS من خلال النقر على اسم البرنامج النصي. للحصول على معلومات كاملة حول تثبيت واستخدام هذه البرامج، انظر لا يتم تضمين برامج الشرح DAWGPAWS manual.These في برنامج DAWGPAWS ويجب أن يتم تثبيت بشكل منفصل. وهنا بعض الملامح الرئيسية "DAWGPAWS": FASTA ملف التلاعب لإعداد تسلسل للخط أنابيب الشرح شرح الثغرات في المجالس تسلسل تنفيذ برامج أساسه التعليق التوضيحي الجينات والشرح جين قافز في خط أنابيب إنتاجية عالية خط أنابيب BLAST مناسبة للاستخدام في إطار الحوسبة العنقودية تحويل الانتاج من البرامج الشرح إلى تنسيق ملف مهرجان الخليج السينمائي المشترك تحويل الملفات مهرجان الخليج السينمائي إلى تنسيق game.xml متوفرة في جميع البرامج سطر الأوامر باستخدام أعلام تعليمات سطر الأوامر. معلومات التعليمات وملفات اليدوي الكامل لا تزال قيد التطوير لبعض البرامج. لمساعدة الوصول حيث progname هو اسم برنامج على حدة: progname --usage إنشاء رسالة استخدام الأساسية مع المعلومات على الوسائط المطلوبة progname --help إنشاء رسالة مساعدة أكثر شمولا يتضمن الحجج المطلوبة وجميع الخيارات progname --man عرض دليل كامل للبرنامج و صفحات دليل لبرامج الفردية المتاحة على موقع على شبكة الإنترنت DAWGPAWS وبما في ذلك في تحميل الإصدار 1.0، من مجموعة DAWGPAWS. متطلبات: perl.

dawgpaws. برامج ذات صلة